Takara SMART-Seq v4 full-length transcriptome analysis with ultimate sensitivity for ultra-low RNA inputs

제품 개요

SMART-Seq v4 Kit (SSv4) 및 SMART-Seq v4 PLUS Kit (SSv4 PLUS)는 Takara의 SMARTer 초저량 RNA 솔루션의 4세대 제품으로, 극히 적은 RNA 입력에서도 최상의 감도를 제공합니다.
이 키트는 oligo(dT) 프라이밍을 사용하여 최대 1,000개의 세포 또는 10 pg–10 ng의 총 RNA로부터 고품질 전장 cDNA를 직접 생성합니다.
SSv4 PLUS 키트는 라이브러리 준비 키트와 단회용 Unique Dual Index (UDI) 플레이트를 포함하여 Illumina 호환 시퀀싱 라이브러리를 제작할 수 있는 완전한 엔드-투-엔드 솔루션입니다.

SMART 기술

SMART (Switching Mechanism at 5' End of RNA Template) 기술은 전장 트랜스크립트 정보를 제공하여 트랜스크립트 아이소폼, 유전자 융합, 포인트 변이 등의 분석을 가능하게 합니다.
SMART-Seq v4는 Smartseq2 방법을 개선하고 LNA(locked nucleic acid) 기술을 도입하여 템플릿 스위칭 효율을 향상시켰으며, 다른 방법보다 더 많은 유전자를 검출할 수 있습니다.
이 키트는 높은 재현성, 균일한 유전자 본체 커버리지, GC-풍부 트랜스크립트의 정확한 표현을 제공합니다.

SSv4 PLUS 키트 특징

SSv4 PLUS 키트에는 특허받은 라이브러리 준비 키트가 포함되어 있으며, 효소 절단 및 스템-루프 어댑터를 사용해 고품질 Illumina 호환 라이브러리를 제작합니다.
이 2단계 워크플로는 단일 튜브에서 약 2시간 내에 완료되며, 중간 정제 단계가 필요 없어 샘플 혼동, 손실, 오염을 최소화합니다.
높은 라이브러리 수율을 통해 고처리량 시퀀서에서의 시퀀싱 또는 향후 분석용 라이브러리 저장이 가능합니다.

권장 대체 제품

• 초저량 RNA 시퀀싱용 재구성 버전:
  SMART-Seq mRNA LP (Cat. #634768, 634769, 634771)
  SMART-Seq mRNA (Cat. #634772, 634773, 634770)

SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit (Cat. #634888–634894) 및 SMART-Seq v4 PLUS Kit (Cat. #R400752, R40753)는 곧 단종 예정입니다. 자세한 내용은 지역 영업 담당자에게 문의하십시오.

주요 특징

• 단일 튜브 워크플로: cDNA 합성과 라이브러리 준비를 각각 한 튜브에서 수행하여 샘플 손실 및 혼동 최소화
• 탁월한 감도: 최소 10 pg RNA 입력으로 시작 가능 (입력 범위: 최대 1,000세포 또는 10 pg–10 ng RNA)
• 고품질 RNA-seq 데이터: 전장 트랜스크립트 정보 제공, 낮은 rRNA 비율, GC 풍부 트랜스크립트 우수 표현
• 시퀀싱 효율 향상: Unique Dual Index 포함으로 다중 샘플 풀링 및 NovaSeq™ 시스템에서 신뢰성 높은 시퀀싱 가능
• 높은 라이브러리 수율: 고처리량 시퀀서에서 효율적 시퀀싱 및 추가 분석용 라이브러리 확보 가능

응용 분야

• 다수의 세포 또는 총 RNA로부터 트랜스크립톰 시퀀싱용 cDNA 합성
• SSv4 키트로 생성된 cDNA는 SMART-Seq Library Prep 키트(SSv4 PLUS 구성품) 또는 Ion Xpress Plus Fragment Library Kit를 사용하여 Illumina 또는 Ion Torrent 시퀀싱에 활용 가능

추가 제품 정보

제품의 Certificate of Analysis에서 보관 조건, 구성품, 기술 사양을 확인할 수 있습니다.
Product Components List는 Documents 탭에서 확인 가능합니다.

제품 이미지

Figure 1. SMART-Seq v4 PLUS는 Nextera® XT보다 더 많은 라이브러리를 생성하고 더 많은 유전자를 검출합니다.
Panel A: SSv4 화학을 사용하여 Mouse Brain Total RNA 10 pg으로부터 3회 반복 cDNA 생성 후 Illumina 호환 라이브러리 제작 및 NextSeq® 500 시퀀싱 수행.
Panel B: SSv4 PLUS 키트의 라이브러리 수율이 Nextera XT보다 높음.
Panel C: SSv4 PLUS 키트가 Nextera XT보다 더 많은 유전자를 검출함.