Takara SMART-Seq v4 3` DE Kit—simplified high-performance single-cell differential expression analysis

제품 개요

단일 세포 수준에서 유전자 발현의 차이를 이해하는 것은 세포 집단 내 다양성을 연구하는 데 중요합니다.
Takara의 SMART-Seq v4 3' DE Kit는 단일 세포의 mRNA 전사체 3' 말단에 시퀀싱 데이터를 집중시키는 엔드 캡처(end-capture) 방식을 적용하여, 더 적은 시퀀싱 리드로도 고품질 데이터를 수집할 수 있도록 설계되었습니다.
이 키트는 업계 표준인 SMART-Seq v4 기술을 기반으로 하며, SMART (Switching Mechanism at 5' End of RNA Template) 메커니즘과 LNA (Locked Nucleic Acid) 기술을 적용했습니다.

또한, Read 2에 셀 바코드로 작용하는 인라인 인덱스(in-line index) 가 포함되어 있어, Illumina 인덱스 페어당 최대 12개의 샘플을 풀링할 수 있습니다. 이를 통해 시퀀싱 레인당 최대 1,152개의 샘플을 동시에 분석할 수 있으며, 연구 시간과 비용을 크게 절감할 수 있습니다.
이 키트는 1–10.5 µl의 입력량에 대응하며, Illumina® Nextera® XT DNA Library Preparation Kit를 사용합니다.
다음의 Illumina 시퀀싱 플랫폼과 호환됩니다: HiSeq®, NextSeq®, MiSeq®, MiniSeq™.

주요 특징

• 향상된 SMART 기술 기반 화학
  SMART-Seq v4 올리고와 LNA 기술 및 개선된 반응 조성으로 높은 민감도, 재현성, GC-풍부 유전자 검출 능력 향상.
• 3' 엔드 캡처 프로토콜
  시퀀싱 리드를 3' 말단에 집중시켜 민감도를 유지하면서 필요한 리드 수를 줄여 효율적인 발현 차이 분석 가능.
  자세한 내용은 기술 노트 참조.
• 샘플 풀링 기능
  인라인 인덱스를 통한 셀 바코딩으로 Illumina 인덱스 페어당 최대 12개 샘플 풀링 가능 (시퀀싱 레인당 최대 1,152 샘플).

응용 분야

• 단일 세포의 차등 발현 분석용 3' 엔드 캡처 mRNA-seq용 cDNA 합성

추가 정보

• 제품의 Certificate of Analysis에서 보관 조건, 구성품, 기술 사양 확인 가능
• Kit Components List를 통해 구성품 상세 확인 가능
• 관련 문서는 Documents 탭에서 다운로드 가능
• 데이터 및 FAQ는 NGS Learning Center에서 확인 가능
• 시퀀싱 데이터 디멀티플렉싱 소프트웨어는 SMART-Seq DE3 Demultiplexer 페이지 참조