Thermo Fisher Scientific Analysis Module Next-Generation Confirmation (NGC) Software

Applied Biosystems™ Analysis Module Next-Generation Confirmation (NGC) Software

Applied Biosystems™ Analysis Module Next-Generation Confirmation (NGC)는 Thermo Fisher Cloud 환경에서 호스팅되는 CE Sanger 시퀀싱 분석 소프트웨어입니다.
NGC는 무료로 Apps Page에서 접근할 수 있습니다.

주요 기능

• CE 시퀀스 ab1 파일에서 변이 탐지
• NGS 변이와 CE 변이 비교
• 시각적 확인을 위한 Venn 다이어그램 생성
• SNP 탐지, 발견, 검증 및 서열 확인 기능
• 자동으로 유전체 데이터베이스에서 참조 서열 검색 및 주석 보고
• NGS 변이(vcf 파일)와 Sanger 변이를 동일한 정렬 뷰에서 비교
• 표준 VCF 형식으로 변이 내보내기 가능

참고: 이형접합 결실 및 삽입 확인은 향후 소프트웨어 릴리스에서 지원 예정입니다.

소프트웨어 특징

• NGS 플랫폼에서 생성된 변이 확인
• NGS 및 CE 플랫폼의 변이를 동일한 뷰에서 표시
• 간단한 워크플로우로 30분 이내 학습 가능
• 운영체제 제한 없음 (iOS 포함), 웹 브라우저로 접근
• 사용자 유지보수 불필요
• 클라우드 기반으로 분석 용량 확장
• 등록 사용자 간 프로젝트 공유 및 협업 가능
• 각 변이에 대한 유전체 좌표 보고 및 자동 주석 검색
• 전기영동도에서 관심 영역으로 손쉬운 탐색
• 색상 코드 요약으로 품질 확인 및 마커 빠른 조회
• 다중 분석 플롯 자동 정렬 (정방향/역상보)
• 변이 결과를 표준 vcf 형식으로 내보내기

Next-Generation Confirmation Module v2.0의 새로운 기능

• KB Basecaller v1.4.2.2: 분석되지 않은 .ab1 트레이스의 재분석 및 신뢰도 높은 QV 값 제공
• 프로젝트 템플릿 선택: 이전 분석 프로젝트 설정 재사용 가능
• 최적화된 QC 플래그 설정: 다양한 CE 장비에서 생성된 모든 .ab1 파일의 품질 상태 표시
• .ab1 파일 내보내기: 향후 분석을 위해 공유 또는 재사용 가능
• GRCh38 인간 참조 지원: Primer Designer 분석 지원 (Primer Designer 링크)
• 기존 프로젝트 설정 가져오기: 선호하는 분석 설정 재사용
• GeneBank 파일 지원: 사용자 지정 주석 업로드 가능 (인간 및 기타 종)
• HGVS 지원: HGVS 명명법으로 유전자형 및 아미노산 변화 보고
• 맞춤형 변이 보고: 테이블 및 보고서에 필요한 열 구성 가능
• 시료 수준 유전자형 보고서: 시료별 유전자형 내보내기 가능
• 아미노산 변화 보고 개선: mRNA 전사체 정보 기반 보고
• Ion Reporter™ 및 NGS 사용자 경험 개선: Thermo Fisher Cloud에서 직접 .vcf 파일 업로드 지원

사양

제품 이미지