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1개 옵션 · 카탈로그 번호를 클릭하면 복사됩니다Norgen · Norgen EXTRAClean Urine Cell-Free Circulating RNA Purification Midi Kit
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소변 유래 순환 RNA 및 엑소좀 RNA를 신속하고 간편하게 정제하는 키트. 다양한 소변 입력량(2~10 mL)에 대응하며, 페놀 추출 없이 고순도의 RNA 확보 가능. NGS, RT-PCR 등 다양한 후속 분석에 적합. 안정적인 컬럼 기반 정제 방식 제공.
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Norgen EXTRAClean Urine Cell-Free Circulating RNA Purification Midi Kit
제품 개요
Norgen의 EXTRAClean Urine Cell-Free Circulating RNA Purification Kits는 다양한 소변 입력량(250 μL ~ 30 mL)에서 순환 RNA 및 엑소좀 RNA를 빠르고 재현성 있게 정제할 수 있는 키트입니다.
Midi Kit은 2 mL ~ 10 mL의 소변 시료용으로 설계되어 있으며, 대용량 시료 처리 후 Mini 컬럼을 이용해 50~100 μL로 최종 농축합니다.
주요 특징 및 장점
- 다양한 소변 입력량(2~10 mL)에 대응
- 페놀 추출 불필요
- 순환 RNA 및 엑소좀 RNA를 유연한 용출 부피로 농축
- 정제된 RNA는 Small RNA Sequencing, RT-PCR, Northern blot 등 다양한 후속 분석에 적합
- EXTRAClean 레진 매트릭스를 통한 고순도 RNA 확보
제품 사양
| 항목 | 내용 |
|---|---|
| 샘플 유형 | 신선 또는 냉동 소변 |
| 샘플 부피 범위 | 2 ~ 10 mL |
| 최소 용출 부피 | 50 μL |
| 최대 용출 부피 | 100 μL |
| 10회 정제 소요 시간 | 약 40–45분 |
| 정제 가능한 RNA 크기 | 모든 크기 (miRNA 및 small RNA 포함, <200 nt) |
| 평균 수율 | 시료에 따라 상이함 |
※ 평균 수율 및 RNA 정량 방법은 프로토콜 6페이지 참고
구성품
| 구성품 | Mini (Cat. 72900) | Midi (Cat. 72910) | Maxi (Cat. 72920) |
|---|---|---|---|
| Binding Solution K | 25 mL | 75 mL | 1×75 mL + 1×25 mL |
| Lysis Buffer A | 30 mL | 20 mL | 20 mL |
| Wash Solution A | 18 mL | 18 mL | 18 mL |
| Elution Solution A | 6 mL | 6 mL | 6 mL |
| Collection Tubes | 50 | 20 | 10 |
| Elution Tubes (1.7 mL) | 50 | 20 | 10 |
| EXTRAClean Mini Spin Columns | 50 | 20 | 10 |
| EXTRAClean Midi Spin Columns | - | 20 | - |
| EXTRAClean Maxi Spin Columns | - | - | 10 |
| Product Insert | 1 | 1 | 1 |
보관 조건 및 안정성
- 모든 버퍼는 밀봉 상태로 실온 보관
- 출하일로부터 2년간 안정적 사용 가능
- Lysis Buffer A에서 염이 침전될 경우, 60°C에서 20분간 가열하여 용해 권장
Supporting Data
Figure 1. Read Quality Distribution
제목: Read Quality Distribution
Y축: Percentage of Read Distribution (0%~100%)
X축:
| Type | Volume | Donor 1 | Donor 2 |
|---|---|---|---|
| Mini | 1000 μL | Donor 1 | Donor 2 |
| Midi | 6000 μL | Donor 1 | Donor 2 |
| Maxi | 20000 μL | Donor 1 | Donor 2 |
범례:
- reads_without_adapter
- short_reads
- UniVec_contaminants
- rRNA
- reads_used_for_alignment
Figure 2. Genome Mapping Distribution
제목: Percentage of Input Reads mapping to Human Genome
Y축: Percentage of Mapping (0.00~70.00)
X축:
| 구분 | Donor 1 | Donor 2 | Donor 1 | Donor 2 | Donor 1 | Donor 2 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 용량 | 1000 μL | 1000 μL | 6000 μL | 6000 μL | 20000 μL | 20000 μL |
| 타입 | Mini | Mini | Midi | Midi | Maxi | Maxi |
범례:
🟩 genome
🟦 not_mapped_to_genome_or_libs
Figure 3. Biotype Distribution of Input Reads Mapping to Transcriptome
Y축: Percentage of Mapping (0.00~45.00)
X축:
| 구분 | Donor 1 | Donor 2 |
|---|---|---|
| Mini (1000 μL) | Donor 1 | Donor 2 |
| Midi (6000 μL) | Donor 1 | Donor 2 |
| Maxi (20000 μL) | Donor 1 | Donor 2 |
범례:
- miRNA_sense
- piRNA_sense
- circularRNA_sense
- Mapping to genome but not Transcriptome
- tRNA_sense
- gencode_sense
- Miscellaneous mapping to transcriptome
Documentation
- EXTRAClean Urine Cell-Free Circulating RNA Purification Kit (Mini) - Protocol (50 preps)
- EXTRAClean Urine Cell-Free Circulating RNA Purification Kit (Midi) - Protocol (20 preps)
- EXTRAClean Urine Cell-Free Circulating RNA Purification Kit (Maxi) - Protocol (10 preps)
Short Protocols
Flyer
FAQ
Q1. 가변 속도 원심분리기가 없을 경우?
A. 고정 속도 원심분리기를 사용할 수 있으나, 수율이 다소 감소할 수 있습니다.
Q2. 원심분리 온도는?
A. 모든 단계는 실온에서 수행합니다. 4°C에서도 성능 저하는 없습니다.
Q3. 시약 부피를 다르게 사용하면?
A. 수율과 품질이 저하될 수 있습니다. 용출 부피가 클수록 수율은 증가하지만 농도는 낮아집니다.
Q4. 최종 용출 전 드라이 스핀을 생략하면?
A. Wash Solution A가 잔류하여 RNA 품질이 저하될 수 있습니다.
Q5. 2차 용출이 가능한가요?
A. 가능합니다. 단, 첫 번째 용출 부피의 50% 이하로 수행하고 별도 튜브에 수집하는 것이 좋습니다.
Q6. RNA 수율이 낮은 이유는?
A. 개인별 차이 및 시료 특성에 따라 소변 내 RNA 함량이 낮을 수 있습니다. 입력 소변량을 늘리면 개선될 수 있습니다.
Q7. A260:280 비율이 2.0보다 낮은 이유는?
A. 소변 내 순환 RNA는 짧은 RNA 조각이 많아 일반적으로 1.0~1.6 범위입니다. 이는 후속 분석에 영향을 주지 않습니다.
Q8. 정제 RNA의 후속 반응 효율이 낮은 경우?
A. 제공된 용출 버퍼 외의 버퍼를 사용한 경우, EDTA나 계면활성제 등 방해 성분이 포함되어 있을 수 있습니다. 용출 버퍼의 조성을 확인하십시오.
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