
Norgen EXTRAClean Urine Cell-Free Circulating RNA Purification Mini Kit
소변 시료로부터 순환 RNA 및 엑소좀 RNA를 신속하고 간편하게 정제하는 키트입니다. 다양한 입력 부피(250 μL~2 mL)에 대응하며, 페놀 추출 없이 고순도의 RNA를 확보할 수 있습니다. 소형 RNA 시퀀싱 등 다양한 하류 분석에 적합합니다.
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Norgen EXTRAClean Urine Cell-Free Circulating RNA Purification Mini Kit
신뢰성과 재현성이 높은 EXTRAClean 키트는 다양한 소변 시료 부피(250 μL~2 mL)에서 순환 RNA 및 엑소좀 RNA를 빠르고 간단하게 분리 정제할 수 있도록 설계되었습니다. 정제된 RNA는 높은 무결성을 가지며, qPCR, RT-PCR, 노던 블롯, RNase 보호, 프라이머 연장, 발현 분석 등 다양한 하류 응용에 사용할 수 있습니다.
주요 특징 및 장점
- 다양한 소변 입력 부피(250 μL~2 mL) 대응
- 페놀 추출 불필요
- 순환 RNA 및 엑소좀 RNA를 유연한 용출 부피로 농축
- 정제된 RNA는 소형 RNA 시퀀싱 등 NGS 분석에 적합
- EXTRAClean 수지 매트릭스가 고순도 RNA 확보 보장
제품 구성 및 사양
Kit Specifications
| 항목 | 내용 |
|---|---|
| 샘플 종류 | 신선 또는 냉동 소변 |
| 샘플 부피 범위 | 250 μL ~ 2 mL |
| 최소 용출 부피 | 50 μL |
| 최대 용출 부피 | 100 μL |
| 10회 정제 소요 시간 | 약 25–30분 |
| 정제 가능한 RNA 크기 | 모든 크기 (miRNA 및 <200 nt 소형 RNA 포함) |
| 평균 수율 | 시료에 따라 다름 |
※ 평균 수율 및 RNA 정량 방법은 프로토콜 5페이지 참조
Storage Conditions and Product Stability
모든 완충액은 밀봉하여 실온 보관하며, 출하일로부터 2년간 안정합니다. Lysis Buffer A에서 염 침전이 관찰될 경우 60°C에서 20분간 가열 후 사용을 권장합니다.
| 구성품 | Mini (Cat. 72900) |
|---|---|
| Binding Solution K | 25 mL |
| Lysis Buffer A | 30 mL |
| Wash Solution A | 18 mL |
| Elution Solution A | 6 mL |
| Collection Tubes | 50개 |
| Elution Tubes (1.7 mL) | 50개 |
| EXTRAClean Mini Spin Columns | 50개 |
| Product Insert | 1부 |
Supporting Data
Read Quality Distribution (읽기 품질 분포)
- Y축: Percentage of Read Distribution (0–100%)
- X축: Mini(1000μL), Midi(6000μL), Maxi(20000μL) 각각 Donor 1, Donor 2
- 범례: reads_without_adapter, short_reads, UniVec_contaminants, rRNA, reads_used_for_alignment
| Category | Donor | Volume | 구성 항목 |
|---|---|---|---|
| Mini | Donor 1 | 1000μL | reads_without_adapter, short_reads, UniVec_contaminants, rRNA, reads_used_for_alignment |
| Mini | Donor 2 | 1000μL | 동일 |
| Midi | Donor 1 | 6000μL | 동일 |
| Midi | Donor 2 | 6000μL | 동일 |
| Maxi | Donor 1 | 20000μL | 동일 |
| Maxi | Donor 2 | 20000μL | 동일 |
Percentage of Input Reads Mapping to Human Genome
- Y축: Percentage of Mapping (0–70%)
- X축: Mini(1000μL), Midi(6000μL), Maxi(20000μL) 각각 Donor 1, Donor 2
- 범례: genome(녹색), not_mapped_to_genome_or_libs(파란색)
| 용량 | Donor | genome | not_mapped_to_genome_or_libs |
|---|---|---|---|
| Mini (1000μL) | Donor 1 | 녹색 막대 | 파란색 막대 |
| Mini (1000μL) | Donor 2 | 녹색 막대 | 파란색 막대 |
| Midi (6000μL) | Donor 1 | 녹색 막대 | 파란색 막대 |
| Midi (6000μL) | Donor 2 | 녹색 막대 | 파란색 막대 |
| Maxi (20000μL) | Donor 1 | 녹색 막대 | 파란색 막대 |
| Maxi (20000μL) | Donor 2 | 녹색 막대 | 파란색 막대 |
Biotype Distribution of Input Reads Mapping to Transcriptome
- Y축: Percentage of Mapping (0–45%)
- X축: Mini(1000μL), Midi(6000μL), Maxi(20000μL) 각각 Donor 1, Donor 2
- 범례: miRNA_sense, piRNA_sense, circularRNA_sense, Mapping to genome but not Transcriptome, tRNA_sense, genecode_sense, Miscellaneous mapping to transcriptome
Documentation
- Mini Kit Protocol (50 preps)
- Midi Kit Protocol (20 preps)
- Maxi Kit Protocol (10 preps)
- Short Protocols (Mini, Midi, Maxi)
- Flyer PDF
FAQ
Q. 가변 속도 원심분리기가 없을 경우?
A. 고정 속도 원심분리기를 사용할 수 있으나 수율이 감소할 수 있습니다.
Q. 원심분리 온도는?
A. 모든 단계는 실온에서 수행합니다. 4°C에서도 성능에 영향은 없습니다.
Q. 시약 부피를 다르게 사용하면?
A. 품질 및 수율이 감소할 수 있습니다. 용출 부피가 많으면 수율이 증가하지만 농도는 낮아집니다.
Q. 건조 스핀을 생략한 경우?
A. Wash Solution A가 오염될 수 있으며 RNA 품질이 저하됩니다.
Q. 2차 용출이 가능한가요?
A. 가능합니다. 1차 용출 부피의 50%로 수행하며, 별도 튜브에 용출하는 것이 좋습니다.
Q. RNA 수율이 낮은 이유는?
A. 소변 내 RNA 함량은 개인차가 크며, 입력 부피를 늘리면 수율을 향상시킬 수 있습니다.
Q. A260:280 비율이 낮은 이유는?
A. 순환 RNA는 짧은 RNA 조각이 많아 1–1.6 범위의 비율이 일반적이며, 하류 분석에는 영향이 없습니다.
Q. 정제 RNA의 하류 성능이 낮은 경우?
A. 제공된 용출 버퍼 외의 용액 사용 시, EDTA나 염류가 포함되어 있으면 성능 저하가 발생할 수 있습니다.
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