Thermo Fisher Scientific Ion AmpliSeq Cancer Hotspot Panel v2

Thermo Fisher Scientific Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2

Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2는 인간 암 유전자에서 자주 발견되는 변이 부위(hot spot)를 대상으로 멀티플렉스 PCR을 수행하기 위한 단일 프라이머 풀입니다. 이 패널은 암 연구를 위한 타깃 시퀀싱 라이브러리 제작에 최적화되어 있습니다.
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주요 특징

• FFPE 샘플과의 호환성을 유지하면서 변이 콘텐츠 확장
• 균일한 커버리지로 효율적인 시퀀싱 및 비용 절감
• 최적화된 프라이머 디자인으로 낮은 스트랜드 바이어스 및 높은 변이 검출 정확도
• Torrent Suite Software v3.0 및 Variant Caller Plugin을 통한 향상된 변이 검출 감도

추가 변이 콘텐츠로 확장된 암 연구

이 패널은 50개의 종양 관련 유전자에서 약 2,800개의 COSMIC 변이를 포함하는 207개의 암플리콘을 증폭합니다.
기존 패널의 46개 유전자, 739개 변이에 더해 EZH2, GNA11, GNAQ, IDH2 등의 추가 변이 부위가 포함되었습니다.
Ion AmpliSeq™ Library Kit 2.0과 함께 사용하도록 설계되었습니다.

균일한 커버리지로 효율적이고 경제적인 시퀀싱

향상된 프라이머 디자인으로 커버리지 균일성이 개선되어, 적은 시퀀싱 량으로도 충분한 깊이를 확보할 수 있습니다.
이를 통해 샘플 멀티플렉싱이 가능하며, 시퀀싱 비용 절감과 변이 검출 신뢰성을 높입니다.

단순하고 빠른 Ion AmpliSeq™ 워크플로우

• FFPE 조직 등 다양한 샘플에서 10ng의 DNA로 타깃 라이브러리 제작 가능
• 표준 PCR 장비로 약 3.5시간 내 라이브러리 구축
• 단일 또는 바코딩된 다중 샘플 시퀀싱 모두 지원

Torrent Suite Software v3.0을 통한 향상된 변이 검출

Torrent Suite Software와 Variant Caller Plugin을 사용하면 DNA 추출부터 변이 검출까지 약 10시간 내 수행할 수 있습니다.
업데이트된 알고리즘으로 낮은 빈도의 SNP 및 indel 검출 감도가 향상되었으며, Ion Reporter™ Software를 통해 변이 주석 분석이 가능합니다.

사양

제품 이미지

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