Takara Single-cell ATAC-seq

Takara Single-cell ATAC-seq

개요

Epigenomic 정보는 유전자 조절에 대한 더 깊은 통찰을 제공하지만, 동일한 세포 유형 내에서도 개별 세포의 염색질 상태가 서로 다를 수 있습니다. Takara의 ICELL8 플랫폼은 단일 세포 수준에서 ATAC-seq 라이브러리를 생성할 수 있는 고효율 솔루션을 제공합니다.
이 시스템은 4–5시간 내에 1,000개 이상의 세포로부터 자동으로 scATAC-seq 라이브러리를 생성할 수 있습니다.

ATAC-seq: 전장 염색질 접근성 지도 생성

ATAC-seq은 Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing의 약자로, 전장 유전체 수준에서 염색질 접근성을 분석하는 기술입니다.
이 방법은 활성화된 Tn5 transposase를 이용하여 접근 가능한 염색질 부위에 DNA 어댑터를 선택적으로 삽입합니다.
이후 PCR을 통해 증폭된 DNA 조각을 시퀀싱 라이브러리로 변환하여, 전장 수준의 염색질 접근성 맵을 생성합니다.
이를 통해 전사인자 결합 부위, 뉴클레오솜 위치, 유전자 발현 조절 메커니즘을 동시에 분석할 수 있습니다.

ICELL8 플랫폼에서의 ATAC-seq

Takara의 ICELL8 Single-Cell System (Cat. No. 640000)과 CellSelect Software를 이용하면, 기존 방법 대비 약 20배 높은 처리량으로 단일 세포 ATAC-seq을 수행할 수 있습니다.
자동화된 칩 기반 워크플로우를 통해 다음 과정이 이루어집니다:

1. 세포 분리 및 선택: ICELL8 시스템을 이용해 1,000개 이상의 생존 세포를 자동으로 분리 및 선택
2. 칩 사이클링: ICELL8 Chip Cycler에서 tagmentation, indexing, PCR 증폭을 칩 위에서 수행
3. 라이브러리 준비: 증폭된 full-length amplicon을 칩 밖으로 모아 정제 후 최종 시퀀싱용 라이브러리 생성

주요 사양

제품 이미지

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