Norgen 16S V5-V7 Library Preparation Kit for Illumina
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Illumina 플랫폼용 16S V5-V7 앰플리콘 라이브러리 준비 키트. 다양한 시료에서 추출된 DNA에 최적화된 프로토콜 제공. 4시간 이내에 간편하게 라이브러리 준비 가능. 최대 384개의 듀얼 인덱스 라이브러리 생성 지원. -20°C에서 1년 안정적 보관.
브랜드: Norgen
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Norgen 16S V5-V7 Library Preparation Kit for Illumina
SKU: 70840
Illumina 플랫폼에서 16S V5-V7 앰플리콘 라이브러리를 차세대 염기서열 분석(NGS)에 사용할 수 있도록 준비하기 위한 시약과 구성품을 포함한 키트입니다.
Features and Benefits
- 다양한 시료(대변, 토양, 수질, 타액, 식물, 소변, 피부 등)에서 분리된 DNA에 최적화된 프로토콜
- 단순하고 빠른 워크플로우: 5시간 이내에 라이브러리 준비 가능
- Norgen의 메타게노믹스 워크플로우 구성품
- 최대 384개의 고유 듀얼 인덱스 라이브러리 준비 가능
Sample type purification kit guide
Product Description
이 키트는 Illumina 플랫폼용 16S V5-V7 앰플리콘 라이브러리 준비에 필요한 모든 분자 시약(프라이머, 효소 혼합물, 인덱스, 버퍼 등)을 제공합니다.
PCR 정제는 고객이 제공하는 AMPure XP Magnetic Beads를 사용하며, 두 단계에서 신속한 핵산 정제를 수행합니다.
정제된 DNA 입력물은 다양한 시료(대변, 토양, 물, 타액, 식물, 소변, 피부 스왑, 질 스왑, 구강 스왑, 혈장/혈청, 혀 스왑, 잇몸 스왑 등)로부터 사용할 수 있습니다.
워크플로우는 약 4시간 내에 완료되며, 다음 단계로 구성됩니다.
- 16S rRNA 유전자의 V5-V7 영역을 증폭하는 타깃 PCR 수행
- AMPure XP 비드를 이용한 PCR 산물 정제
- 듀얼 인덱스 프라이머를 사용하는 제한 사이클 인덱스 PCR
- 인덱스가 부착된 앰플리콘 정제
- 라이브러리 정량화, 풀링 및 시퀀싱 준비
Library Preparation Workflow (OCR from image)
Total Library Prep Time: 4 hrs
| 단계 | 시간 | 작업 내용 |
|---|---|---|
| 1 | 2.5 hrs | Amplicon PCR |
| 2 | 30 min | PCR Clean Up |
| 3 | ~30 min | Index PCR |
| 4 | 30 min | PCR Clean Up 2 |
| 5 | (시간 미표기) | Quantification & Pooling |
| 6 | (시간 미표기) | Library Denaturing & Sequencing |
Supporting Data
Figure 1. 16S V5-V7 PCR1 Amplification (OCR from image)
Norgen’s FastRunner DNA Ladder
| bps | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 2000 | ||||||
| 1500 | ||||||
| 1000 | ||||||
| 750 | ||||||
| 500 | ||||||
| 300 |
Stool DNA
1 2 3
No Template
1 2 3
Figure 2. 16S V5-V7 Indexed Libraries (OCR from image)
Norgen’s FastRunner DNA Ladder
| bps | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 2000 | ||||||
| 1500 | ||||||
| 1000 | ||||||
| 750 | ||||||
| 500 | ||||||
| 300 |
Stool DNA
1 2 3
Figure 3. BioAnalyzer Trace of the 16S V5-V7 Indexed Library (OCR from image)
NGI-MXXX-REPLICATE-C-SV/07
[세로축]
FU
1000
900
300
0
[가로축]
35 100 150 200 400 600 1000 1080
DegSpecifications
| 항목 | 내용 |
|---|---|
| Minimum amount of starting material | 2.5 µL of DNA (5 ng/µL) |
| Time to complete library preparation | 4 hours |
Storage Conditions and Product Stability
- 24 prep kit은 1개의 박스로, 96 prep kit은 2개의 서브 컴포넌트로 제공됩니다.
- 모든 키트는 도착 즉시 -20°C에 보관해야 합니다.
- 지정된 조건에서 최소 1년간 안정적으로 보관 가능합니다.
| Step | Component | Cat. 70800 (24 preps) | Cat. 70810/70820/70830/70840 (96 preps) |
|---|---|---|---|
| Amplicon PCR (PCR 1) | MGX Master Mix | 330 µL | 1,320 µL |
| 16S V5-V7 Primer Mix | 70 µL | 280 µL | |
| Index PCR (PCR 2) | Indexing Master Mix | 660 µL | 2 × 1,320 µL |
| N7xx Index Primer | 50 µL | 50 µL | |
| S5xx Index Primer | 70 µL | 70 µL | |
| PCR Clean-Up | Resuspension Buffer | 2 × 1,250 µL | 2 × 5,000 µL |
| Nuclease-free water | 1,250 µL | 6,000 µL |
Documentation
Protocols
Safety Data Sheets
Citations
| 항목 | 내용 |
|---|---|
| Title | Characterization of the urogenital microbiome in Miniature Schnauzers with and without calcium oxalate urolithiasis |
| Journal | Journal of Veterinary Internal Medicine, 2022 |
| Authors | Emily L. Coffey, Andres M. Gomez, Erin N. Burton, Jennifer L. Granick, Jody P. Lulich, Eva Furrow |
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