Applied Biosystems™

SNaPshot™ Multiplex Kit

SNaPshot™ Multiplex System은 SNP(single nucleotide polymorphism)를 최대 10개까지 다중처리하는 primer extension 기반 방식입니다. 이 시스템을 사용해 SNP을 스크린 및 확인하고자세히 알아보기

SNaPshot™ Multiplex System은 SNP(single nucleotide polymorphism)를 최대 10개까지 다중처리하는 primer extension 기반 방식입니다. 이 시스템을 사용해 SNP을 스크린 및 확인하고 DNA methylation을 평가하며 BAC 지문을 찾고 샘플의 스크래피 감수성 검사를 합니다.

• SNP 최대 10개의 multiplexed, single-base 연장.
• 크로마솜 위치와 상관없이 multiple SNP 정보 확보
• 단일 염기쌍별로 다른 SNP loci 분리.
• 소량의 증폭 template로 확실한 multiple SNP 정보 확보 가능.
• 적절한 가격으로 비용 절감
• 제대로 검사되고 이해하기 쉬운 single-base extension 기술로 실험의 복잡성이 절감됨.

SNP 스크린 및 확인
SNaPshot™ Multiplex System은 SNP 스크리닝과 검증에 완벽한 도구입니다. 이 키트에는 DNA fragment를 라벨링할 수 있는 single-base extension⁄termination 시약을 시험관 하나에 제공합니다. 우선 Applied Biosystems™ capillary electrophoresis 기기에서 GeneScan™-120 LIZ™ Size Standard을 사용해 DNA fragment를 분석하여 표지된 fragment 크기를 측정합니다. 그리고 GeneMapper™ Software를 사용해 해당 데이터를 분석하고 allele calls을 생성합니다. SNaPshot™ Multiplex Kit는 한 tube, 한 capillary에서 최대 10개 primer-template 조합으로 single-base extension을 하며 멀티플렉싱을 가능하게 합니다.

DNA 메틸화 평가
methylation⁄epigenetics 시험은 암 연구에 중요한 요인으로 주목받고 있습니다. 메틸화 검출의 전형적인 분석법에서는 DNA의 bisulfite 처리로 non-methylated cytosine을 탈아미노하여 uracil로 전환시키면서 methylated cytosine가 비반응 상태를 유지하게 합니다. 그 다음 PCR 증폭 단계에서 uracil bases를 thymine으로 바꿉니다. SNaPshot™를 사용해 처리 샘플과 미처리 샘플의 염기 차이를 정량적으로 검출하여 샘플의 매틸화 상태를 알 수 있습니다.

Fingerprint BACs
새로운 BAC 라이브러리는 특징 분석(fingerprinting), 클론의 contigs 어셈블리(contiguous consensus sequences), 그리고 크로마솜의 물리적 맵핑 정렬을 위해 신속하고 효율적인 방법을 요구합니다. SNaPshot™ Multiplex Kit를 사용해 클론의 지문을 알아낼 수 있습니다(fingerprint). 제한 endonucleases 절단 후 BAC fragment를 라벨링하고 라벨 표지된 fragment를 분리하여 Applied Biosystems™ capillary electrophoresis 기기에서 검출할 수 있습니다. GeneMapper™ Software v3.5 이상에서 구한 크기 정보를 편집 및 contig 어셈블리 프로그램으로 가져옵니다. SNaPshot™ Multiplex Kit에서 얻은 우수한 결과는 high-throughput BAC fingerprinting에 사용하기 쉽고 비용 효과적인 해답을 제공합니다.

샘플의 Scrapie 감수성 스크린
다른 프리온 질병처럼 스크래피는 숙주 암호화된 단백질의 비정상 isoform 때문에 발생합니다. SNaPshot™ system은 단일 염기쌍 민감도가 높아 프리온 유전자의 코돈 차이로 샘플을 정확하게 스크리닝합니다. SNaPshot™ Multiplex System을 사용해 이런 단백질을 암호화하는 유전자에서 SNP를 스크리닝할 수 있습니다. 예를 들어 양과 염소의 PrP 유전자 codons 136, 154, 171의 다형성이 비정상적으로 배가된 단백질 산물 isoform를 만들어 스크래피가 야기됩니다.

이 제품은 연구용으로만 사용가능합니다. 진단 절차에 사용할 수 없습니다.

사양

검출 방법Primer-probe

형식Kit

반응 속도9 hr.

기술SNP Genotyping (Fragment Analysis-Based), Primer Extension

용도(장비)3500 Series Genetic Analyzers, SeqStudio Flex Series Genetic Analyzers, SeqStudio Genetic Analyzer, 3730/3730xl Genetic Analyzers

제품라인SNaPshot™

제품 유형Multiplex Kit

수량100 reactions

실행 시간9 hr.

종All Species

타겟SNPs (Known)

용도(애플리케이션)Genotyping

반응 수100 Reactions, with protocol

샘플 종류DNA

Unit SizeEach