Thermo Fisher Scientific Axiom Multispecies 9 Genotyping Array, 384-HT format
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다종(9종) 동식물의 SNP 기반 유전형 분석용 고처리량 마이크로어레이로, 친자확인·형질선택·품종식별·유전체연관분석에 활용. 48,440 SNP 포함, GeneTitan 시스템과 연계 사용. 384-HT 포맷으로 자동화된 분석 지원.
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Applied Biosystems™ Axiom™ Multispecies 9 Genotyping Array, 384-HT format
Axiom Multispecies 9 Genotyping Array는 꿀벌, 해바라기, 벼, 대두, 강낭콩, 소, 양, 말, 개 등 9종의 동식물 종에서 친자확인 및 형질 선택을 위한 유전형 분석에 사용됩니다. 이 제품은 Axiom Agrigenomics Genotyping 솔루션의 일부로, GeneTitan Multi-Channel Instrument에서 자동화된 공정을 통해 유전체 DNA의 하이브리디제이션, 염색, 세척, 이미징 및 데이터 출력 과정을 수행합니다.
주요 특징
- 48,440개의 SNP 포함
- 다종(9종) 동식물의 유전형 분석 지원
- 고처리량(High-throughput) 자동화 시스템과 호환
- Affymetrix Expert Design Program을 통해 개발
Array 구성
| 종(Species) | SNP 수 | 주요 용도 및 특징 |
|---|---|---|
| Honeybee (Apis Mellifera) | 12,000 | 친자확인, 품종개량 |
| Sunflower (Helianthus) | 10,763 | 형질 선택 및 유전 분석 |
| Rice | 8,875 | Illumina bead chip CORNELL-IR_Rice_LD 기반 4,029 SNP 포함 |
| Soybean (Glycine Max) | 6,019 | 품종 식별 및 유전적 개선 |
| Common Bean (Phaseolus vulgaris) | 4,734 | 품종 및 형질 분석 |
| Bovine | 2,463 | 친자확인, 형질선택, ISAG core panel 포함 |
| Ovine | 1,991 | 질병 식별, 육질 및 기생충 저항성 마커 포함 |
| Equine | 989 | 질병 식별, ISAG 친자확인, Axiom Equine Array (670K) 마커 430개 포함 |
| Canine | 606 | 150종 이상 질병 마커 포함, ISAG core panel 기반 친자확인 |
응용 분야
- 친자 분석 (소, 말, 양, 개)
- 경제적 중요 형질 식별
- 품종 식별 (특히 대두)
- 유전체 연관 분석 (GWAS)
- 유전적 다양성 연구
- 분자육종: 연관지도 작성 및 유전체 선택
- 형질 도입(트레이트 인트로그레션)
필요 장비 및 소프트웨어
- GeneChip Command Console Software
- GeneTitan Multi-Channel Instrument
- Axiom Analysis Suite Software
- Axiom Long Format Export Tool (AxLE)
참고 문헌
- Morales et al., 2020. PLOS ONE 논문 링크
제품 사양
| 항목 | 내용 |
|---|---|
| 어레이 유형 | Genotyping |
| 어레이 수 | 384 arrays |
| 형식 | 384 HT-array Plate |
| 수량 | 1 plate |
| Unit Size | 1 plate |
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