Thermo Fisher Scientific Ion AmpliSeq Transcriptome Human Gene Expression Kit, 24 Assays

Ion AmpliSeq™ Transcriptome Human Gene Expression Kit (24 Assays)

제품 개요

Ion AmpliSeq™ Transcriptome Human Gene Expression Kit은 20,000개 이상의 인간 RefSeq 유전자의 발현 수준을 단일 분석에서 동시에 측정할 수 있는 솔루션입니다.
FFPE(포르말린 고정 파라핀 포매) 조직과 같이 RNA가 손상된 시료에서도 소량의 RNA(10 ng)로 고감도의 유전자 발현 분석이 가능합니다.

주요 특징

• 간편한 라이브러리 준비: FFPE, 세포 등 다양한 샘플에서 최소 10 ng의 RNA로 시작
• 20,000개 이상의 인간 RefSeq 유전자 커버리지
• 넓은 동적 범위 및 향상된 감도: 기존 마이크로어레이 대비 우수한 검출 성능
• 자동화된 분석 지원: Torrent Suite™ 소프트웨어 플러그인으로 유전자 정량 및 품질 관리 자동 처리
• 멀티플렉스 시퀀싱 가능: Ion Xpress™ 바코드 어댑터와 호환, 비용 절감 및 처리량 향상

향상된 성능

기존 마이크로어레이 분석보다 넓은 동적 범위와 향상된 유전자 검출 성능을 제공하여, 고감도의 유전자 발현 연구에 적합합니다. 단순한 워크플로우를 통해 2일 이내 샘플에서 유전자 정량 결과를 얻을 수 있습니다.

라이브러리 준비 및 시퀀싱

• 총 RNA(10 ng 이상)로 약 7시간 내 라이브러리 준비 (핸즈온 시간 약 1시간)
• SuperScript™ VILO™ cDNA Synthesis Kit 포함
• Ion AmpliSeq™ 기술로 모든 유전자의 발현 수준을 정확히 유지
• 준비된 라이브러리는 Ion OneTouch™ 2 System 또는 Ion Chef™ System을 사용해 템플릿 준비 후 Ion Proton™ System에서 시퀀싱 수행
• 바코딩을 통한 멀티플렉스 가능 (권장: Ion 550 Chip당 16개, Ion 540/PI Chip당 8개 라이브러리)

자동 데이터 분석

Torrent Suite™ 소프트웨어의 플러그인을 사용하면 유전자 정량 및 리포트 생성이 자동화되어, 별도의 고성능 컴퓨팅 자원이나 생정보학 전문 지식 없이도 결과를 손쉽게 확인할 수 있습니다.
출력된 결과는 모든 유전자의 발현 수준을 포함한 표 형태로 제공되며, 후속 분석 소프트웨어와 호환됩니다.

참고: 본 프로토콜로 생성된 라이브러리는 200-base read 시퀀싱에 적합합니다.

사양