
Norgen Urine Cell-Free Circulating DNA Purification Mini Kit
신선, 보존, 동결 소변에서 고품질의 세포 유리 순환 DNA를 빠르고 간편하게 정제. 모든 크기의 DNA 및 바이러스 DNA 추출 가능. 억제물 없는 DNA로 PCR, qPCR, NGS 등 다양한 분석에 적합. Norgen 특허 수지 기반 스핀 칼럼 기술 사용.
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Norgen Urine Cell-Free Circulating DNA Purification Mini Kit
고품질, 고순도의 억제물 없는 세포 유리 순환 DNA를 소변에서 정제하고 농축하는 신속하고 신뢰성 높은 방법을 제공합니다. 신선, 보존 또는 동결된 소변 샘플에서 순환 DNA와 바이러스 DNA를 모두 분리할 수 있습니다.
주요 특징 및 장점
- 신선, 보존, 동결 소변에서 모든 크기의 순환 DNA 분리
- 바이러스 DNA 분리 가능
- 다양한 소변 입력 부피에 대응
- 유연한 용출 부피로 DNA 농축
- 억제물 없는 세포 유리 순환 DNA 확보
- Norgen의 Urine Preservative 및 타사 보존제와 호환
- Norgen 특허 수지 기반 스핀 칼럼 크로마토그래피 기술 적용
제품 설명
이 키트는 소량의 체액으로부터 고품질의 세포 유리 순환 DNA를 빠르고 간편하게 정제할 수 있는 올인원 솔루션입니다. 정제된 DNA는 PCR, qPCR, 메틸화 민감 PCR, Southern blot, 마이크로어레이, NGS 등 다양한 하류 응용에 바로 사용 가능합니다.
배경 정보
세포 유리 순환 DNA(cf-DNA)는 암 조기 진단 및 질병 모니터링을 위한 생체표지자 연구에서 중요한 정보를 제공합니다. 소변은 비침습적이며 대량 채취가 가능하고, 반복 샘플링이 용이하다는 장점이 있습니다. 소변 내 핵산은 혈장과 유사한 프로파일을 가지며, 단백질 농도가 낮아 정제가 용이합니다. cf-DNA는 주로 150~250 bp 크기의 짧은 단편 형태로 존재하며, 세포사멸, 괴사 또는 태아 유래 DNA에서 기원합니다.
제품 구성 및 사양
| 항목 | 내용 |
|---|---|
| SKU | 56600 |
| 최소 소변 입력량 | 250 μL |
| 최대 소변 입력량 | 2 mL |
| 정제 가능한 DNA 크기 | ≥ 50 bp |
| 용출 부피 | 50–100 μL |
| 10회 정제 소요 시간 | 15–20분 |
| 평균 수율 | 시료에 따라 다름 |
* 평균 수율 및 DNA 정량 방법은 제품 설명서 6페이지 참고.
저장 조건 및 안정성
모든 용액은 밀봉하여 실온에 보관합니다. 출하일로부터 2년간 안정하며, Proteinase K는 특수 완충 용액에 녹아 있어 실온에서 최대 2년간 안정합니다.
구성품
| 구성품 | Cat. 56600 (50 preps) | Cat. 56700 (20 preps) | Cat. 56800 (10 preps) |
|---|---|---|---|
| Binding Solution K | 25 mL | 75 mL | 1×75 mL + 1×25 mL |
| Proteinase K | 1.2 mL | 0.3 mL | 0.3 mL |
| Wash Solution A | 38 mL | 2×38 mL | 38 mL |
| Elution Buffer B | 8 mL | 15 mL | 15 mL |
| Mini Spin Columns | 50 | 20 | 10 |
| Midi Spin Columns | - | 20 | - |
| Maxi Spin Columns | - | - | 10 |
| Collection Tubes | 50 | 20 | 10 |
| Elution Tubes (1.7 mL) | 50 | 20 | 10 |
| Product Insert | 1 | 1 | 1 |
워크플로우 요약 (이미지 OCR 통합)
Urine Cell-Free Circulating DNA Purification Midi Kit (Cat.#56700)
2–10 mL의 소변을 단순한 2단계 칼럼 절차로 처리하여 50 μL로 농축.
단계별 절차
- Cell-Free Urine: Binding Solution K 추가 후 vortex
- Transfer to column: 세척 후 유출액 폐기
- Elute in 0.4 mL
- Proteinase K 추가 후 55°C에서 10분 반응
- Lysis Buffer A, Ethanol 추가 후 vortex
- Mini spin column으로 이동 후 원심분리 반복
- 2회 세척 후 50 μL 용출 (필요 시 재용출)
- DNA는 하류 분석에 바로 사용 가능
실험 데이터 요약
Figure 1. 다양한 소변 부피(0.5, 1, 2 mL)에서 DNA 정제 결과
| Urine Volume | Average Ct. Value |
|---------------|-------------------|
| 0.5 mL | 27.17 |
| 1 mL | 26.22 |
| 2 mL | 25.35 |
Figure 2. 입력 부피에 따른 5S rRNA 유전자 선형성
| 시료량 | 상대적 5S rRNA 양 | % of Linearity |
|--------|------------------|----------------|
| 0.5mL | 0.07 | 100 |
| 1mL | 0.13 | 97 |
| 2mL | 0.23 | 92 |
Figure 3. PCR 입력 부피에 따른 Ct 값 변화
| PCR Input Volume | 0.5mL Urine | 1mL Urine | 2mL Urine |
|------------------|--------------|------------|------------|
| 2µL | 약 27 | 약 26 | 약 25.5 |
| 4µL | 약 25 | 약 24 | 약 23.5 |
| 8µL | 약 23 | 약 22 | 약 21.5 |
Figure 4. Midi Kit에서 소변 부피별 DNA 정제 결과
| Urine Volume | Average Ct. Value |
|---------------|-------------------|
| 2 mL | 25.28 |
| 5 mL | 23.96 |
| 10 mL | 23.07 |
문서 자료
- 56600 Mini Kit Protocol (50 Preps)
- 56700 Midi Kit Protocol (20 Preps)
- 56800 Maxi Kit Protocol (10 Preps)
- Application Note 82 - DNA Molecular Weight Determination
- SDS - Mini Kit
FAQ 요약
- 원심분리 온도: 실온에서 수행 (4°C에서도 성능 영향 없음)
- 단백질 분해 효소 반응: 55–60°C에서 수행
- 두 번째 용출: 가능, 첫 번째 용출의 50% 부피 권장
- RNA 제거: 불필요 (RNA 비공정제거)
- 소변 샘플 준비: 세포 제거 후 cell-free 상태로 사용
- 냉동 소변 시료: 해동 후 바로 사용 가능 (추가 원심분리 금지)
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