Thermo Fisher Scientific Axiom Equine Genotyping Array

Applied Biosystems™ Axiom™ Equine Genotyping Array

Axiom Equine Genotyping Array (Axiom MNEC670)는 Affymetrix의 Expert Design Program을 통해 미네소타 대학교 및 Equine Genetic Diversity Consortium(EGDC)과 협력하여 설계된 말 유전형 분석용 어레이입니다.
이 어레이는 20개의 서로 다른 말 품종을 대상으로 유전형 분석이 가능하며, 말 유전학 연구에 최대의 활용성을 제공합니다.

670,796개의 마커는 200만 개의 후보 마커 중에서 선별되어, 가축화된 말 품종 간 알려진 유전적 다양성을 최적으로 포괄하도록 설계되었습니다. Axiom Genotyping Solution 기반으로, 현재 이용 가능한 기술 중 가장 높은 데이터 완성도, 호출률(call rate), 재현성을 제공합니다.

주요 특징

• 전문 설계: 말 유전학 분야 주요 연구자들의 참여로 개발
• 고해상도 포맷: 96 어레이 포맷으로 다양한 유전형 분석 응용 지원
• 광범위한 품종 커버리지: 20개 말 품종 분석 가능

하이라이트

Content

• 총 670,796개의 마커 포함
  • 약 400,000개의 between-population tag SNPs
  • 약 200,000개의 within-population tag SNPs
  • 약 70,000개의 legacy array SNPs
  • 주요 조직적합성 복합체(MHC) 영역 내 추가 SNP 밀도 제공

Diversity

Axiom Equine Genotyping Array는 20개 품종 내외에서 최대 180만 개 마커까지 정확한 임퓨테이션(imputation)이 가능하도록 설계되었습니다. 상업적으로 중요한 품종을 중심으로 마커 선택이 이루어졌습니다.

응용 분야

• 복잡 형질 연구:
  • 전장 유전체 분석 및 정밀 매핑
  • 다양성 분석
  • 질병 위험 예측
• 분자 육종:
  • 연관 분석(association mapping)
  • 육종 프로그램 효율 향상
  • 선택 신호 분석(selection signature analysis)

협력 기관

Equine Genetic Diversity Consortium(EGDC)은 미네소타 대학교가 주도하는 국제 말 유전학 연구 커뮤니티로, 전 세계 말 개체군의 유전적 다양성을 종합적으로 이해하기 위한 협력 연구를 수행하고 있습니다.
EGDC 공식 웹사이트

필요 제품

• GeneChip Command Console Software
• GeneTitan Multi-Channel Instrument

제품 사양