Thermo Fisher Scientific Axiom Maize Genotyping Array

Applied Biosystems™ Axiom™ Maize Genotyping Array

Axiom Maize Genotyping Array는 독일 교육연구부(BMBF)의 지원을 받은 AgroClustER Synbreed 프로젝트를 통해 설계되었습니다.
이 프로젝트는 Technische Universität München의 Professor Chris-Carolin Schön, Dr. Eva Bauer, Sandra Unterseer와 Helmholtz Zentrum München의 Dr. Georg Haberer, Michael Seidel이 주도하였으며, Affymetrix Expert Design Program을 통해 개발되었습니다.

이 어레이는 옥수수 유전체의 글로벌 다양성을 대표하는 616,201개의 다형성 변이를 포함하며, 반복 서열이 많은 유전체 구조적 다양성과 낮은 LD(연관 불균형) 등 옥수수 품종 간의 특수한 유전체적 도전 과제를 극복하도록 설계되었습니다.
SNP는 30개의 자식 계통(inbred line)을 재서열하여 발견되었으며, 유럽, 미국, 열대 및 준열대 Dent와 Flint 유전자 풀의 다양한 계통을 통해 검증되었습니다.

주요 특징 (Features)

• 포괄적 콘텐츠: 총 616,201개의 변이 포함 (609,442 SNPs 및 6,759 인델 variants)
• 고품질 검증: 다양한 글로벌 옥수수 품종을 통해 검증 완료
• 연구 중심 설계: Expert Design Program을 통한 맞춤형 유전체 연구 지원

응용 분야 (Applications)

• 복잡 형질 연구
  • 유전적 다양성 분석
  • 연관 분석 (Association Mapping)
  • 전유전체 분석 및 선택
  • 옥수수 품종의 하플로타입 구조 연구
  • LD 분석
  • QTL 매핑
• 분자육종
  • 신규 자식 계통 개발
  • 유전체 선택 (Genomic Selection)

Expert Design Arrays 설명

Expert Design Arrays는 식물 및 동물 유전체학 분야의 주요 연구자들이 설계한 제품으로, 연구 및 육종 프로그램 발전을 위해 공개된 어레이입니다.
이 어레이의 유전 마커와 주석(annotation)은 설계 고객이 제공한 정보를 기반으로 하며, 일반 카탈로그 제품과는 달리 업데이트되지 않습니다.
Affymetrix는 이러한 프로그램을 통해 농업유전체 연구자들에게 동료 연구자들이 활용한 유전자형 분석 어레이를 지속적으로 제공합니다.

필수 사용 제품 (Required Products)

• Axiom Analysis Suite
• GeneChip Command Console Software
• GeneTitan Multi-Channel Instrument

제품 사양 (Specifications)