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1개 옵션 · 카탈로그 번호를 클릭하면 복사됩니다Norgen · Norgen EXTRAClean Plasma/Serum RNA Purification Midi Kit
Norgen EXTRAClean Plasma/Serum RNA Purification Midi Kit
고품질의 세포유리 순환 RNA 및 엑소좀 RNA를 간편한 스핀 칼럼 방식으로 정제하고 농축할 수 있는 제품입니다. 페놀 추출 없이 빠르고 신뢰성 있는 RNA 분리 과정을 제공합니다.
주요 특징 및 장점
- 다양한 혈장/혈청 입력 범위 지원
- 페놀 추출 불필요
- 초원심분리 과정 없이 빠른 RNA 정제
- EXTRAClean 레진 매트릭스를 통한 고순도 RNA 확보
- NGS 등 고감도 응용에 최적화된 품질 관리
제품 설명
이 키트는 EDTA 또는 Citrate로 처리된 혈액으로부터 얻은 신선 또는 냉동 혈장/혈청 샘플에서 RNA를 정제할 수 있습니다.
Heparin 처리 혈장은 RT-PCR 등 하류 응용에 간섭을 일으킬 수 있으므로 사용하지 않습니다.
정제된 RNA는 PCR, qPCR, RT-PCR, Northern blot, RNase protection, primer extension, expression array, NGS 등 다양한 응용에 사용 가능합니다.
EXTRAClean 컬럼은 오염을 최소화하기 위한 엄격한 품질 관리 과정을 거쳐 제작되어, NGS와 같은 민감한 분석에서도 최적의 결과를 제공합니다.
Background
혈장 또는 혈청 내의 세포유리 RNA 및 엑소좀 RNA는 암 및 질병 상태의 바이오마커로 활용될 수 있습니다.
엑소좀은 대부분의 세포에서 분비되는 40–100 nm 크기의 소포로, 다양한 체액(혈액, 소변, 타액 등)에서 발견됩니다.
이들은 세포 간 정보 전달을 수행하며, 면역 반응, 조직 재생, 신경 전달 등 생리적 기능에 영향을 미칠 수 있습니다.
엑소좀 내 RNA는 RNase로부터 보호되어 있어 안정적으로 회수 가능합니다.
Midi Kit 정보
이 키트는 두 개의 칼럼 시스템을 사용합니다.
- 입력 범위: 250 μL ~ 1.5 mL
- 1차 칼럼으로 대량 샘플 처리 후, 미니 칼럼으로 농축
- 최종 엘루션: 50 μL ~ 100 μL
Kit Specifications
| 항목 | 내용 |
|---|---|
| Sample Type | Plasma/Serum |
| Anti-Coagulant (for Plasma)† | EDTA or Citrate |
| Sample Volume Range | 250 μL to 1.5 mL |
| Minimum Elution Volume | 50 μL |
| Maximum Elution Volume | 100 μL |
| Time to Complete 10 Purifications | 35–40 minutes |
| Size of RNA Purified | All sizes, including miRNA and small RNA (<200 nt) |
| Average Yields¥ | Variable depending on specimen |
† Heparin 처리 혈장은 RT-PCR 등 응용에 간섭을 일으킬 수 있으므로 사용하지 않습니다.
¥ 평균 수율 및 RNA 정량 방법은 제품 설명서 참조.
Storage Conditions and Stability
모든 용액은 밀봉하여 실온 보관하며, 출하일로부터 2년간 안정적입니다.
Lysis Buffer A에 염 침전이 관찰되면 60°C에서 20분간 가열하여 용해시킵니다.
구성품
| Component | Cat. 73700 (50 preps) | Cat. 73710 (20 preps) | Cat. 73720 (10 preps) |
|---|---|---|---|
| Lysis Buffer A | 2 × 20 mL | 100 mL | 130 mL + 30 mL |
| Wash Solution A | 18 mL* | 38 mL* + 18 mL* | 38 mL* |
| Elution Solution A | 6 mL | 6 mL | 6 mL |
| Elution Buffer F | – | 15 mL | 15 mL |
| EXTRAClean Micro Spin Columns | 50 | – | – |
| EXTRAClean Mini Spin Columns | – | 20 | 10 |
| EXTRAClean Midi Spin Columns | – | 20 | – |
| EXTRAClean Maxi Spin Columns | – | – | 10 |
| Collection Tubes | – | 20 | 10 |
| Elution Tubes (1.7 mL) | 50 | 20 | 10 |
| Product Insert | 1 | 1 | 1 |
- 사용 전 준비 시 주의사항은 제품 노트 참조.
Supporting Data
Figure 1. Read Quality Distribution
각 Donor(1–3) 및 Norgen 추출 조건(Mini, Midi, Maxi)에 따른 Read Quality 분포(%)를 나타냅니다.
- Y축: Percentage of Read Distribution (0–100%)
- X축 그룹:
- Norgen Mini (200 μL): Donor 1–3
- Norgen Midi (850 μL): Donor 1–3
- Norgen Maxi (3250 μL): Donor 1–3
- 범례: reads_without_adapter, short_reads, UniVec_contaminants, rRNA, reads_used_for_alignment
Figure 2. Percentage of Input Reads Mapping to Human Genome
각 Donor별로 입력 리드가 인간 게놈에 매핑된 비율을 표시합니다.
- Y축: Percentage of Mapping (0–80%)
- X축 그룹: Mini, Midi, Maxi (각각 Donor 1–3)
- 범례: genome (green), not_mapped_to_genome_or_libs (blue)
Figure 3. Biotype Distribution of Input Reads Mapping to Transcriptome
각 Norgen 조건(Mini, Midi, Maxi) 및 Donor(1–3)에 대해 Transcriptome에 매핑된 리드의 Biotype 분포를 나타냅니다.
- Y축: Percentage of Mapping (0–70%)
- 범례: miRNA_sense, tRNA_sense, piRNA_sense, gencode_sense, circularRNA_sense, Miscellaneous mapping, Not mapping to transcriptome
Documentation
- Protocol - Midi Kit (Cat. 73710)
- Short Protocol - Midi Kit
- Safety Data Sheet (SDS)
- ExtraClean Kits Flyer
FAQs
- Variable speed centrifuge unavailable? Fixed speed 사용 가능하지만 수율 감소 가능성 있음.
- Centrifuge temperature: 실온에서 수행, 4°C에서도 성능 영향 없음.
- Reagent volume variation: 지정된 용량 변경 시 RNA 품질 및 수율 저하 가능.
- Dry spin 미실시: Wash Solution A 오염으로 RNA 품질 저하 가능.
- Second elution: 가능하나 1차의 50% 용량으로 별도 튜브 사용 권장.
- Low RNA yield: Plasma/Serum RNA 함량은 개인차 존재, 입력량 증가로 개선 가능.
- A260:280 ratio < 2.0: 짧은 RNA 특성으로 정상 범위(1–1.6).
- Poor downstream performance: 제공된 Elution Buffer 외 사용 시 염, 세제 등 간섭 가능.
- DNase treatment 필요 여부: 필요 시 [RNase-Free DNase I Kit (Cat# 25710)] 사용 권장.
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