Thermo Fisher Scientific Oncomine Lung cfDNA Assay

Thermo Fisher Scientific Oncomine™ Lung cfDNA Assay

제품 개요

Oncomine™ Lung cfDNA Assay는 폐암 연구를 위한 완전한 솔루션 중 하나로, 혈장 내 cfDNA에서 폐 종양 유래 DNA(ctDNA)를 검출하기 위한 시약입니다.
이 키트는 라이브러리 구축을 위한 시약과 다중 PCR 프라이머 풀을 제공하여, 단일 혈액 샘플에서 얻은 cfDNA로부터 앰플리콘 라이브러리를 준비할 수 있습니다.
비소세포폐암(NSCLC)에서 자주 변이되는 단일염기변이(SNV) 및 짧은 인델(indel)을 분석할 수 있으며, 11개 유전자(ALK, BRAF, EGFR, ERBB2, KRAS, MAP2K1, MET, NRAS, PIK3CA, ROS1, TP53)와 150개 이상 핫스팟을 커버합니다.

주요 특징

• 짧은 cfDNA(약 170 bp)에 최적화된 앰플리콘 설계
• SNV 및 짧은 indel 검출 가능 (LOD 0.1%)
• 고도로 다중화된 NGS 기반 타깃 시퀀싱으로 비용 절감
• 높은 민감도와 특이성으로 낮은 수준의 변이 검출 가능
• 단일 튜브 혈액에서 2일 내 결과 획득 가능한 효율적 워크플로우

액체생검 연구의 장점

• 비침습적 샘플링으로 반복적인 종양 모니터링 가능
• 조직 샘플 대비 낮은 비용
• 빠른 결과 획득
• 종양의 이질성 포착 가능
• 향후 진료 표준 개선 가능성

워크플로우 개요

MagMAX™ Cell-Free DNA Isolation Kit를 이용한 cfDNA 분리부터 Ion Chef™ System 및 Ion S5™ XL Sequencing System을 이용한 분석까지 전체 과정은 약 2일 내 완료됩니다.
Oncomine Lung cfDNA Assay는 0.1%까지 낮은 검출한계를 제공하며, 20 ng cfDNA 입력 시 0.1% LOD 달성 가능합니다. 입력량이 적을 경우 LOD는 증가합니다.

Simplicity, Speed, and Scalability

• 최소 1 ng의 cfDNA로 타깃 라이브러리 구축 가능
• 표준 PCR 장비 사용, 두 단계 PCR 반응으로 라이브러리 증폭
• 추가 장비 투자 최소화
• FFPE 샘플과의 호환성으로 일치성 연구 가능
• 타깃 라이브러리 구축 시간 약 3.5시간
• Tag Sequencing Barcode Set 1–24로 확장성 확보

사양

참고 문서

Target 및 hotspot BED 파일, cfDNA Variant Analysis용 Torrent Suite Software 5.2 사용자 가이드 문서는 Documents 섹션에서 확인 가능합니다.

제품 이미지

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