Thermo Fisher Scientific ERCC ExFold RNA Spike-In Mixes

Invitrogen™ ERCC ExFold RNA Spike-In Mixes

RNA 발현 데이터의 차이는 시작 물질의 품질, 세포 수준, RNA 수율, 사용 플랫폼, 실험 수행자 등의 다양한 요인에 의해 발생할 수 있습니다. 이러한 변동 원인을 제어하기 위해 NIST(National Institute of Standards and Technology) 주관 아래 External RNA Controls Consortium (ERCC)에서 외부 RNA 대조 세트를 개발하였습니다.
이 대조 세트는 샘플 분리 후 RNA 분석 실험에 추가하여 정의된 성능 기준에 따라 측정할 수 있도록 설계된 미표지 polyadenylated transcript 세트로 구성됩니다.

현재 Thermo Fisher Scientific의 Ambion™ 브랜드에서 NIST 인증 DNA 플라스미드로부터 추출된 92개 transcript를 포함한 ERCC Spike-In Control Mix를 제공합니다. 각 transcript는 250∼2,000 nt 범위로 천연 진핵세포 mRNA를 모방합니다.

핵심 제품 특징

• 유전자 발현 실험 전반의 데이터 비교를 위한 표준 척도 제공
• 실험 민감도(검출 하한) 및 역동 범위 측정 가능
• 분화 유전자 발현 정량에 활용 가능

RNA 분석의 잠재력

유전자 발현 프로파일링, 전체 transcriptome 분석 등을 통해 질병 상태의 발현 패턴을 이해하고 세포 운명, 발생, 질병 진행을 조절하는 생물학적 경로와 분자 기전을 탐구할 수 있습니다.
기존 qRT-PCR 및 microarray 방법 외에도 차세대 시퀀싱(NGS) 기술의 확산으로, 다양한 플랫폼 간 데이터 비교를 위한 표준 척도의 중요성이 커지고 있습니다.

정확한 결과 달성 및 비교

Ambion™ ERCC RNA Spike-In Control은 여러 샘플과 플랫폼 간 RNA 표준 측정을 가능하게 합니다.
두 가지 spike-in mix 제형(ExFold RNA Spike-In Mix 1, Mix 2)을 통해 민감도, 역동 범위 등 다양한 척도를 평가할 수 있으며, 두 mix 간 일치도를 이용해 높은 신뢰도의 발현 배수 변화 비율을 계산할 수 있습니다.
각 mix는 92개 transcript로 구성되어 있으며, 4개의 하위군을 통해 몰농도 기반 정량이 가능합니다.
이 대조 세트는 SOLiD™ System, Illumina™ Sentrix™ BeadChip 등 다양한 NGS 및 microarray 플랫폼에 적합합니다.

다양한 ERCC Kit 구성 옵션

역동 범위 측정 또는 발현 배수 변화 분석을 위해 두 가지 kit 구성으로 제공됩니다.

• ERCC Spike-In Mix: 각 실험 플랫폼에서 역동 범위 및 검출 한계 측정
• ERCC ExFold Spike-In Mix: 분화 유전자 발현 측정의 정확성 평가

* ERCC RNA Spike-In Mix 1과 ExFold Spike-In Mix 1은 동일한 ERCC transcript 제형을 포함하나, 배수 변화 평가 시 ExFold Spike-In Mix 1 대신 사용할 수 없습니다. 반드시 동일 제조번호의 ExFold Spike-In Mix 1과 Mix 2를 함께 사용해야 합니다.

이 제품은 연구용으로만 사용 가능합니다. 진단 목적으로 사용할 수 없습니다.

제품 사양