
Norgen Soil DNA Isolation 96-Well Kit (Magnetic Bead System)
토양 시료에서 박테리아와 숙주 DNA를 빠르고 간편하게 정제하는 96웰 마그네틱 비드 시스템 키트. 다양한 토양 유형 처리 가능하며, 고품질 DNA를 PCR 등 후속 분석에 바로 사용 가능. 로봇 자동화 시스템과 호환되어 고처리량 분석에 적합.
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Norgen Soil DNA Isolation 96-Well Kit (Magnetic Bead System)
SKU: 62800
신속하고 간편한 토양 유래 미생물 및 숙주 DNA 정제를 위한 96웰 마그네틱 비드 시스템 키트입니다.
주요 특징 및 장점
- 마그네틱 비드 기반의 빠르고 간편한 처리
- 화학적 및 기계적 균질화를 결합한 강력한 용해 시스템
- 고품질의 게놈 DNA 확보
- 억제물질 없는 일관된 고수율 (최대 50 kb 이상)
- 세균, 곰팡이, 조류 등 다양한 미생물의 시퀀싱 등급 DNA 추출 가능
- 로봇 자동화 시스템에 통합 가능한 96웰 포맷 제공
제품 개요
Norgen의 Soil DNA Isolation Kit (Magnetic Bead System)는 다양한 토양 시료(일반 토양, 퇴비, 분뇨 등)로부터 게놈 DNA를 빠르고 재현성 있게 분리할 수 있습니다.
제공된 OSR(Organic Substance Removal) Solution을 통해 휴믹산을 완전히 제거하여 PCR 저해물질이 없는 고품질 DNA를 확보할 수 있습니다.
정제된 DNA는 PCR 등 모든 후속 응용에 바로 사용 가능합니다.
지원 데이터
Figure 1. DNA 분리 결과 (Top soil vs Clay)
Top soil과 Clay 시료에서 분리된 DNA를 비교한 결과, 마그네틱 비드 시스템을 이용한 키트에서 우수한 DNA 무결성과 수율이 확인되었습니다.
이미지 내 데이터 구조:
Top soil: M, C, 1–5 / Clay: C, 6–10, M
두 토양 유형 모두 “Mag bead” 처리군으로 표시됨.
Figure 2. DNA 농도 비교
Column 방식과 Magnetic Bead 방식 간 DNA 농도 비교 결과, 두 방식 모두 유사한 DNA 농도를 보였습니다.
이미지 내 텍스트:
Concentration (ng/µL)
Column A B C D E
Top Soil
Column A B C D E
ClayFigure 3. Real-time PCR 결과
Real-time PCR을 통해 16s rDNA를 검출한 결과, 마그네틱 비드 시스템으로 분리한 DNA는 컬럼 방식과 동등한 증폭 효율을 보였으며 PCR 저해가 없음을 확인했습니다.
이미지 내 텍스트:
Amplification
RFU
CyclesFigure 4. Hierarchical Clustering Dendrogram
5가지 토양 유형(Potting soil, Clay, Mulch, Top soil, Compost)에서 분리된 DNA의 계통 군집 결과.
| Potting soil | Clay | Mulch | Top soil | Compost |
|---------------|------|--------|-----------|----------|
| A | B | A | B | A | B | A | B | A | B |
Figure 5. Principal Coordinate Analysis (PCoA, Illumina MiSeq)
20개 시료(25–28: Mulch, 29–32: Clay, 33–36: Potting soil, 76–78: Top soil, 79–82: Compost)의 분류학적 분포를 비교한 결과, 각 토양 유형이 명확히 구분됨.
이미지 내 텍스트:
- 축: Principal Coordinate 1 / Principal Coordinate 2
- 상단 메뉴: Kingdom, Phylum, Class, Order, Family, Genus, Species
- 데이터 포인트 예시: 30, 31, 35, 36, 38, 39, 75, 76
Figure 6. Top Soil DNA 분리 결과
Top soil에서 분리된 DNA의 무결성과 일관성이 우수함을 확인.
Marker = Norgen’s HighRanger DNA Ladder (Cat. 11900).
Figure 7. Real-time PCR 검증
96웰 마그네틱 비드 시스템으로 분리한 토양 DNA를 이용한 16s rRNA 검출에서 PCR 저해 없이 높은 품질의 DNA 확인.
Kit Specifications
| 항목 | 사양 |
|---|---|
| 최대 토양 투입량 | 0.25 g (모든 토양 유형) |
| 평균 수율 (0.25 mL 토양 기준)* | 1–5 μg |
| 평균 순도 (OD260/280) | 1.7–1.9 |
| 96회 정제 소요 시간 (자동화) | 약 30분 (핸즈온 타임) |
| 96회 정제 소요 시간 (수동) | 약 90분 (핸즈온 타임) |
* 수율은 토양 유형에 따라 달라질 수 있습니다.
보관 조건 및 안정성
모든 용액은 밀봉하여 실온에서 보관합니다.
출하일로부터 1년간 안정성을 보장합니다.
구성품
| 구성품 | Cat. 58100 (50 preps) | Cat. 62800 (2 x 96-well) |
|---|---|---|
| Lysis Buffer L | 60 mL | 1 × 105 mL, 1 × 60 mL |
| Lysis Additive A | 6 mL | 25 mL |
| Binding Buffer I | 7 mL | 25 mL |
| OSR Solution | 3 mL | 12 mL |
| Binding Buffer B | 2 × 12 mL | 85 mL |
| Magnetic Beads B | 1.1 mL | 2 × 2.2 mL |
| Solution WN | 55 mL | 4 × 55 mL |
| Elution Buffer B | 8 mL | 30 mL |
| Bead B Tubes | 2 × 25 | 8 × 25 |
| Elution Tubes (1.7 mL) | 2 × 25 | - |
| 96-Well Plate | - | 2 |
| 96-Well Elution Plate | - | 2 |
| Adhesive Tape | - | 2 |
| Product Insert | 1 | 1 |
자동화
로봇 자동화 시스템과 호환되며, 자동화 프로토콜 스크립트를 요청 시 제공받을 수 있습니다.
문서 자료
- Protocol (50 prep)
- Protocol (2 x 96-well)
- SDS (50 Preps)
- SDS (2x96 Well Plates)
- Product Flyer
- Environmental Solutions Brochure
FAQ 요약
Q1. 마그네틱 비드가 함께 흡입된 경우?
비드와 상등액을 다시 웰에 넣고 혼합 후, 자석판에 재배치하여 분리합니다.
Q2. DNA 수율이 낮은 경우?
- 용해 불완전: Lysis Additive A 추가 및 65°C 인큐베이션 권장
- 비드 혼합 불충분: 사용 전 충분히 혼합
- 토양 내 DNA 함량이 낮은 경우: 65°C 인큐베이션으로 개선 가능
Q3. 정제 DNA가 후속 실험에서 성능이 낮은 경우?
- 갈색 용출액: OSR Solution 추가 필요
- 세척 미흡: Buffer SK로 충분히 세척
- 에탄올 잔류: 건조 단계 필수 수행
Q4. RNA가 함께 용출된 경우?
RNase A 처리로 제거 가능 (제조사 지침 참조).
참고 문헌 예시
| 제목 | 저널 / 연도 | 저자 |
|---|---|---|
| Arbuscular mycorrhizal fungal diversity and potential association networks among African tropical forest trees | Mycorrhiza, 2024 | Damilola Olanipon et al. |
| Symbiotic microbiota vary with breeding group membership in a highly social joint-nesting bird | Behavioral Ecology, 2023 | Leanne A. Grieves et al. |
| Acclimatization of a mixed-animal manure inoculum to anaerobic digestion... | Bioresource Technology, 2017 | Lee, J. T., He, J., & Tong, Y. W. |
| Selection of a Very Active Microbial Community... | Int. J. Environ. Res. Public Health, 2017 | Moretti, G. et al. |
| TRFLP analysis of rhizosphere microbial community... | Soil Biology and Biochemistry, 2014 | MP Columbus, SM Macfie |
제품 이미지







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