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1개 옵션 · 카탈로그 번호를 클릭하면 복사됩니다Norgen · Norgen EXTRAClean Urine Cell-Free Circulating RNA Purification Maxi Kit
Norgen EXTRAClean Urine Cell-Free Circulating RNA Purification Maxi Kit
제품 개요
Norgen의 EXTRAClean Urine Cell-Free Circulating RNA Purification Kits는 다양한 소변 입력량(250 µL~30 mL)으로부터 순환 RNA 및 엑소좀 RNA를 신속하고 재현성 있게 정제할 수 있는 간단한 솔루션을 제공합니다.
정제된 RNA는 높은 무결성을 가지며, 실시간 PCR, RT-PCR, 노던 블롯, RNase 보호, 프라이머 연장, 발현 어레이 분석 등 다양한 후속 응용에 적합합니다.
주요 특징 및 장점
- 다양한 소변 입력량(10~30 mL)에 대응
- 페놀 추출 불필요
- 순환 RNA 및 엑소좀 RNA를 유연한 용출 부피로 농축
- 소형 RNA 시퀀싱 등 다양한 후속 분석에 적합
- EXTRAClean 수지 매트릭스로 고순도 RNA 확보
적용 키트별 정보
- Mini Kit (Cat. 72900): 250 µL~2 mL 시료용
- Midi Kit (Cat. 72910): 2~10 mL 시료용
- Maxi Kit (Cat. 72920): 10~30 mL 시료용
각 키트는 대용량 소변 시료를 1차 컬럼에서 처리한 후, 미니 컬럼에서 농축하여 50~100 µL의 최종 용출을 제공합니다.
Kit Specifications
| 항목 | 내용 |
|---|---|
| Sample Type | Fresh or frozen urine |
| Sample Volume Range | 10–30 mL |
| Minimum Elution Volume | 50 µL |
| Maximum Elution Volume | 100 µL |
| Time to Complete 10 Purifications | 40–50 minutes |
| Size of RNA Purified | All sizes, including miRNA and small RNA (<200 nt) |
| Average Yields | Variable depending on specimen |
※ 평균 수율 및 RNA 정량 방법은 프로토콜 5페이지 참조
Storage Conditions and Product Stability
모든 완충용액은 밀봉하여 실온에 보관합니다.
키트는 출하일로부터 2년간 안정합니다.
Lysis Buffer A에 염 침전이 발생할 경우, 60°C에서 20분간 가온하여 용해하십시오.
| 구성품 | Mini (Cat. 72900) | Midi (Cat. 72910) | Maxi (Cat. 72920) |
|---|---|---|---|
| Binding Solution K | 25 mL | 75 mL | 1 × 75 mL, 1 × 25 mL |
| Lysis Buffer A | 30 mL | 20 mL | 20 mL |
| Wash Solution A | 18 mL | 18 mL | 18 mL |
| Elution Solution A | 6 mL | 6 mL | 6 mL |
| Collection Tubes | 50 | 20 | 10 |
| Elution Tubes (1.7 mL) | 50 | 20 | 10 |
| EXTRAClean Mini Spin Columns | 50 | 20 | 10 |
| EXTRAClean Midi Spin Columns | - | 20 | - |
| EXTRAClean Maxi Spin Columns | - | - | 10 |
| Product Insert | 1 | 1 | 1 |
Supporting Data
Read Quality Distribution
Y축: Percentage of Read Distribution (0–100%)
X축:
| Category | Donor 1 | Donor 2 |
|-----------|----------|----------|
| Mini (1000 µL) | Donor 1 | Donor 2 |
| Midi (6000 µL) | Donor 1 | Donor 2 |
| Maxi (20000 µL) | Donor 1 | Donor 2 |
범례 (Legend):
- reads_without_adapter
- short_reads
- UniVec_contaminants
- rRNA
- reads_used_for_alignment
Figure 1. Average read quality distribution relative to raw reads of small RNA sequencing of cell-free RNA urine samples using EXTRAClean kits.
Percentage of Input Reads Mapping to Human Genome
Y축: Percentage of Mapping (0–70%)
X축:
| Donor | Volume | Label |
|--------|---------|--------|
| Donor 1 | 1000 µL | Mini |
| Donor 2 | 1000 µL | Mini |
| Donor 1 | 6000 µL | Midi |
| Donor 2 | 6000 µL | Midi |
| Donor 1 | 20000 µL | Maxi |
| Donor 2 | 20000 µL | Maxi |
범례 (Legend):
- 🟩 genome
- 🟦 not_mapped_to_genome_or_libs
Figure 2. Genome mapping distribution relative to input reads obtained from small RNA sequencing.
Biotype Distribution of Input Reads Mapping to Transcriptome
Y축: Percentage of Mapping (0–45%)
X축:
| Sample | Volume | Label |
|---------|---------|--------|
| Donor 1 | 1000 µL | Mini |
| Donor 2 | 1000 µL | Mini |
| Donor 1 | 6000 µL | Midi |
| Donor 2 | 6000 µL | Midi |
| Donor 1 | 20000 µL | Maxi |
| Donor 2 | 20000 µL | Maxi |
범례 (Legend):
- miRNA_sense
- piRNA_sense
- circularRNA_sense
- Mapping to genome but not Transcriptome
- tRNA_sense
- genecode_sense
- Miscellaneous mapping to transcriptome
Figure 3. Average small RNA biotype distribution relative to sequencing input reads.
Documentation
- (73900) Mini Kit Protocol (50 preps)
- (73910) Midi Kit Protocol (20 preps)
- (73920) Maxi Kit Protocol (10 preps)
Short Protocols
Flyers
FAQs
Q1. 가변 속도 원심분리기가 없을 경우?
A. 고정 속도 원심분리기를 사용할 수 있으나, 수율이 감소할 수 있습니다.
Q2. 원심분리 온도는?
A. 모든 단계는 실온에서 수행합니다. 4°C에서도 성능 저하가 없습니다.
Q3. 시약량을 다르게 사용하면?
A. RNA 품질 및 수율이 저하될 수 있습니다. 용출 부피가 크면 수율은 증가하나 농도는 낮아집니다.
Q4. 최종 용출 전 건조 회전을 생략하면?
A. Wash Solution A가 잔류하여 RNA 품질에 영향을 줄 수 있습니다.
Q5. 2차 용출이 가능한가요?
A. 가능합니다. 첫 용출의 50% 부피로 별도 튜브에 수행하십시오.
Q6. RNA 수율이 낮은 이유는?
A. 소변 내 RNA 함량은 개인차가 크며, 입력량을 늘리면 수율이 증가합니다.
Q7. A260:280 비율이 낮은 이유는?
A. 대부분 짧은 RNA 조각으로 구성되어 있으며, 1.0–1.6 범위는 정상입니다.
Q8. 정제 RNA가 후속 분석에서 잘 작동하지 않을 때?
A. 제공된 용출 버퍼 외의 버퍼를 사용했을 경우, 염, EDTA, 계면활성제 등 간섭 성분을 확인하십시오.
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