Norgen Soil DNA Isolation Kit (Magnetic Bead System)

Norgen Soil DNA Isolation Kit (Magnetic Bead System)

SKU: 58100

빠르고 간단한 방식으로 토양 시료에서 박테리아 및 숙주 DNA를 정제할 수 있는 마그네틱 비드 기반 시스템입니다.

Features and Benefits

• 빠르고 간단한 마그네틱 비드 기반 처리
• 화학적 및 기계적 균질화를 결합한 강력한 세포 용해 시스템
• 고품질 게놈 DNA 분리
• 50 kb 이상의 억제물 없는 DNA 고수율 확보
• 박테리아, 곰팡이, 조류 등 다양한 미생물로부터 시퀀싱 품질의 DNA 분리
• 로봇 자동화 시스템에 통합 가능한 96웰 형식 제공

Norgen의 Soil DNA Isolation Kit (Magnetic Bead System)은 모든 유형의 토양 시료(일반 토양, 퇴비, 분뇨 등 고휴믹산 함유 토양 포함)에서 게놈 DNA를 빠르고 재현성 있게 분리할 수 있습니다. 제공되는 OSR(Organic Substance Removal) Solution을 사용하여 모든 휴믹산을 제거합니다. 정제된 DNA는 PCR 등 후속 응용에 적합하며, 휴믹산 및 PCR 억제물질이 완전히 제거됩니다.

고처리량 응용을 위해 96웰 형식도 제공되며, 자동화 시스템과 통합 가능합니다.

Supporting Data

Figure 1. Resolution of DNA isolated from two different types of soil samples
DNA는 고휴믹산 토양(top soil)과 일반 토양(clay)에서 각각 Norgen의 Column 기반 Soil DNA Isolation Kit (Red C)와 Magnetic Bead System (Mag Bead)을 사용하여 분리되었습니다. 10 µL의 DNA를 1X TAE 1.2% agarose gel에서 전기영동하였으며, Mag Bead 시스템은 뛰어난 DNA 무결성과 수율을 보여주었습니다.

이미지 OCR 데이터 구조화:

Figure 2. Comparison of DNA concentration
Column 기반과 Magnetic Bead System 간 DNA 농도를 비교하였으며, 두 방법 모두 유사한 DNA 농도를 나타내었습니다.

OCR 데이터:

Concentration (ng/µL)

Column   A   B   C   D   E
Top Soil

Column   A   B   C   D   E
Clay

Figure 3. High DNA quality confirmed by Real-time PCR
16s rDNA 검출을 위한 실시간 PCR 결과에서 Mag Bead 시스템은 Column 기반 방법과 유사한 증폭 효율을 보여주었으며, PCR 억제 없이 우수한 DNA 품질을 확인했습니다.

OCR 데이터:

• 그래프 제목: Amplification
• Y축: RFU
• X축: Cycles (0~45 범위)
• 주요 곡선: ○ (Magnetic Bead), × (Column method)

Figure 4. Hierarchical Clustering Dendrogram
다섯 가지 토양 유형에서 분리된 DNA를 기반으로 한 계층적 군집 분석 결과입니다.

Figure 5. Principal Coordinate Analysis (PCoA)
Illumina MiSeq으로 생성된 PCoA 결과로, 각 토양 유형 간 분류학적 차이를 보여줍니다.

OCR 데이터:

• 상단 메뉴: Kingdom, Phylum, Class, Order, Family, Genus, Species
• 축 레이블: Principal Coordinate 1, Principal Coordinate 2
• 주요 데이터 포인트: 30, 31, 35, 36, 38, 39, 75, 76

Figure 6. Resolution of DNA Isolated from Top Soil
96웰 키트를 사용하여 고휴믹산 토양에서 DNA를 분리하였으며, 높은 무결성과 수율을 확인했습니다.

Figure 7. High Soil DNA Quality Confirmed by Real-time PCR
96웰 형식 키트를 사용하여 16s rRNA 검출을 위한 실시간 PCR 결과에서 PCR 억제 없이 우수한 DNA 품질을 확인했습니다.

Kit Specifications

* 수율은 토양 유형에 따라 달라질 수 있습니다.

Storage Conditions and Product Stability

모든 용액은 밀봉 상태로 실온에서 보관하며, 출하일로부터 1년 동안 안정합니다.

Automation

자동화 프로토콜 스크립트 제공. 전문 연락처 등록 후 접근 가능.

Documentation

Protocols

• PI58100_4 Soil DNA Isolation 50 prep Magnetic Bead System (PDF)
• PI62800_5 Soil DNA Isolation 96-Well Kit Magnetic Bead System (PDF)

Safety Data Sheets

• 58100 - SDS (50 Preps)
• 62800 - SDS (2x96 Well Plates)

Flyers

• Soil DNA Isolation Kit (Magnetic Bead System)
• Environment - Solutions for Isolation and Downstream Applications

FAQs

Q1. Magnetic beads가 함께 피펫팅된 경우?
비드를 시료 웰에 다시 넣고 잘 혼합 후 자력 분리판에 재배치합니다.

Q2. DNA 수율이 낮은 이유?

• 세포 용해 불완전: Lysis Additive A 추가 및 65ºC 인큐베이션 권장
• 비드 혼합 불충분: 사용 전 충분히 혼합
• 토양 내 DNA 농도 낮음: 65ºC 인큐베이션으로 향상 가능

Q3. 정제 DNA가 후속 실험에서 성능이 낮은 경우?

• 갈색 DNA: OSR Solution 추가 필요
• 세척 부족: Buffer SK로 충분히 세척
• 에탄올 잔류: 건조 단계 수행 필수

Q4. RNA가 함께 용출된 경우?
RNase A 처리로 제거 가능. 제조사 지침에 따라 효소량과 조건 설정.

Citations

제품 이미지