Thermo Fisher Scientific Oncomine Comprehensive Assay v3 GX

Oncomine™ Comprehensive Assay v3 GX

Thermo Fisher Scientific Ion Torrent™ Oncomine™ Comprehensive Assay v3 GX는 161개의 유전자에서 SNV, CNV, 유전자 융합, 인델 변이를 검출할 수 있는 타깃 기반 차세대 염기서열분석(NGS) 어세이입니다.
이 키트는 라이브러리 구축을 위한 시약과 4개의 풀 패널(2 DNA, 2 RNA)을 제공하며, FFPE(포르말린 고정 파라핀 포매) 종양 샘플을 이용한 16회 시퀀싱 반응 수행이 가능합니다.

주요 특징

• 161개 유전자 변이 분석 가능
• SNV, CNV, 유전자 융합, 인델 검출
• FFPE 샘플에서 풀당 최소 10 ng(총 40 ng)으로도 우수한 성능
• 분자 표준 및 컨트롤로 특성화
• Oncomine Knowledgebase 기반 콘텐츠로 주요 암 관련 타깃 포괄

워크플로우 및 응용

이 어세이는 수백 개의 변이 결과를 몇 가지 주요 암 구동 유전자로 필터링하는 NGS 워크플로우의 일부입니다.
Oncomine informatics를 통해 변이 결과를 필터링하고, NCCN, FDA, EMA 등의 가이드라인 및 글로벌 임상시험 데이터와 연계된 주석을 제공하여 연구자가 결과를 해석하고 연구 방향을 설정하는 데 도움을 줍니다.
Oncomine Reporter Software와 함께 사용하면 라벨, 가이드라인, 임상시험 정보를 통합한 보고서를 생성할 수 있습니다.

Genexus 시스템과의 통합

이 어세이는 Ion Torrent Genexus Integrated Sequencer 및 Ion Torrent Genexus GX5 Chip에 최적화되어 있으며, 자동화된 라이브러리 준비, 시퀀싱, 분석, 리포팅을 하루 만에 수행할 수 있습니다.
Genexus 시스템은 멀티 레인 시퀀싱 칩을 통해 비용 효율적인 라이브러리 처리 기능을 제공합니다.

연구 적용 사례

이 키트는 미국의 NCI-MATCH 및 일본의 LC-SCRUM과 같은 대규모 임상 연구 프로그램에서도 채택되었습니다.

기술 구성

• 검증된 Ion AmpliSeq™ 화학 기반
• 자동화된 샘플-리포트 워크플로우
• 확장 가능한 시퀀싱 플랫폼
• 최적화된 Oncomine informatics 통합

사양