Thermo Fisher Scientific Axiom Soybean Genotyping Array

Applied Biosystems™ Axiom™ Soybean Genotyping Array

Axiom Soybean Genotyping Array (Axiom SoyaSNP 96-Array Plate)는 재배종 및 야생 대두의 유전체 분석을 위한 180,961개의 마커를 포함합니다.
이 어레이는 Affymetrix Expert Design Program을 통해 한국생명공학연구원(KRIBB), 농촌진흥청, 국립식량과학원과 협력하여 설계되었습니다.
SNP 서열은 정순천 박사, 김남신 박사, 문정경 박사가 제공하였습니다.

대두는 단백질과 오일의 주요 공급원으로, 본 어레이는 야생 및 재배종 대두의 마커를 포함하여 전장 유전체 연관분석(GWAS)과 고밀도 유전지도 작성에 이상적입니다. 이를 통해 대두의 적응 유전자 및 유전적 다양성을 연구할 수 있습니다.

주요 특징

• 포괄적 콘텐츠: 총 180,961개의 마커가 유전체 전반에 걸쳐 배치됨
  • 114,735 SNP (전체의 63.4%)는 40,631개의 유전자 내에 위치
  • 22,952 SNP는 유전자 상하류 5 kb 범위 내 13,259개 영역에 위치
  • 43,274 SNP는 유전자 간(intergenic) 영역에 위치
  • 다양한 대두 접근종을 이용하여 SNP 발견 및 검증 수행

응용 분야

• 복합형질 연구 및 분자육종

  • GWAS 및 정밀 매핑 수행
  • 경제적 중요 형질 식별
  • 고해상도 유전지도 작성 및 자연 변이 탐지

• 분자육종 프로그램

  • 연관분석 및 유전체선발(genomic selection)에 활용

• 집단 및 진화유전학 연구

  • 다양한 기원의 대두 집단 구분
  • 재배종과 야생종 간의 유전적 차이 분석

필요 제품

• Axiom Analysis Suite
• GeneChip Command Console Software
• GeneTitan Multi-Channel Instrument

제품 사양