Thermo Fisher Scientific Ion AmpliSeq ERCC Companion Panel

Ion AmpliSeq ERCC Companion Panel

The Ion AmpliSeq RNA ERCC Companion Panel works with the ERCC RNA Spike-In Mix to provide performance assessment of Ion AmpliSeq Transcriptome libraries in gene expression experiments.
Add the ERCC RNA Spike-In Mix to each RNA sample, then amplify targets with the Ion AmpliSeq Transcriptome panel plus the Ion AmpliSeq RNA ERCC Companion Panel during library preparation.
When analyzing sequencing results, the data from sequenced ERCC targets is compared to the known concentration of the ERCC targets in the Spike-In Mix.

주요 특징

• Ion AmpliSeq Transcriptome 실험의 표준 기준 제공 (다양한 실험 및 플랫폼 간 비교 가능)
• 발현 실험의 검출 한계 및 동적 범위 측정
• ERCC 타깃 성능 평가를 통해 저품질 또는 저수율 샘플 식별 가능

배경 정보

RNA 발현 데이터의 변동은 시료 품질, 세포 함량, RNA 수율, 사용 플랫폼, 실험자 등의 다양한 요인에 의해 발생할 수 있습니다.
이를 제어하기 위해 External RNA Controls Consortium (ERCC)에서는 표준 RNA 컨트롤 세트를 개발하였으며, 이는 NIST가 주관하는 학술 및 산업 협의체에서 제작되었습니다.
ERCC 컨트롤은 폴리아데닐화된 비표지 전사체 세트로, RNA 분석 실험에 시료 분리 후 첨가되어 성능 기준에 따라 측정할 수 있도록 설계되었습니다.

패널 구성

The Ion AmpliSeq RNA ERCC Companion Panel consists of 10 primer pairs targeting 10 selected transcripts from the ERCC RNA Spike-In Mix, representing a 13log₂ dynamic range.
선택된 ERCC 타깃은 일반적인 GC 균형과 선형 증폭(TaqMan qPCR)에 적합하도록 설계되었으며, 정상적인 실험 조건에서 R² > 0.9를 제공합니다.

제품 사양

제품 이미지