Thermo Fisher Scientific GeneChip S. cerevisiae Tiling 1.0R Array

GeneChip™ S. cerevisiae Tiling 1.0R Array

Applied Biosystems™ / Thermo Fisher Scientific

제품 개요

GeneChip™ S. cerevisiae Tiling 1.0R Array는 전장 유전체 분석용 고밀도 마이크로어레이로, Saccharomyces cerevisiae 연구에 최적화되어 있습니다.
이 어레이는 고해상도(5bp) 프로브 설계를 통해 전사체 분석, 단백질-DNA 상호작용 맵핑(ChIP), 폴리모르피즘 탐지 등 다양한 연구 응용에 활용됩니다.

주요 특징

• S. cerevisiae 전장 유전체를 포괄하는 가장 포괄적인 마이크로어레이
• 5 base pair 간격의 고밀도 프로브 설계
• 25-mer 프로브를 통한 높은 결합 특이성
• 다양한 유전체 연구 응용에 적합
• 단일 어레이에 3.2백만 개 이상의 probe pair 포함

Array Profile

이 어레이는 새로운 전사체 탐지, 크로마틴 면역침강(ChIP) 실험에서의 단백질/DNA 결합 부위 맵핑 등 전장 유전체 연구에 사용됩니다.
S. cerevisiae 1.0R Array는 완전 일치/불일치 프로브 쌍 3.2백만 개 이상으로 구성되어 있으며, 전체 S. cerevisiae 게놈을 타일링 방식으로 커버합니다.
디자인은 2003년 10월 Stanford Yeast Genome Database(www.yeastgenome.org)의 게놈 서열 정보를 기반으로 하며, 2-μm circle plasmid (NCBI Accession J01347)에 대한 프로브도 포함합니다.

프로브는 인접한 25-mer 올리고의 중심 위치 기준으로 평균 5bp 간격으로 배치되어, 인접 프로브 간 약 20bp의 중첩을 형성합니다.

참고 문헌:
Gresham D, et al. Genome-wide detection of polymorphisms at nucleotide resolution with a single DNA microarray. Science 311(5769):1932–1936 (2006 Mar 31).

장비 및 소프트웨어 요구사항

• GeneChip Scanner 3000 7G
• GeneChip Operating Software (GCOS) v1.3 이상

사양