Thermo Fisher Scientific AgriSeq Canine Traits and Disorders Panel

Applied Biosystems™ AgriSeq™ Canine Traits and Disorders Panel

The Applied Biosystems AgriSeq Canine Traits and Disorders Panel contains 154 markers targeting clinically important canine traits and disorders. The panel includes SNPs and complex markers such as MNPs and InDels. Most markers are common to all breeds, while some are breed-specific for certain traits and conditions. The panel enables multiplexed simultaneous genotyping using the AgriSeq targeted genotyping-by-sequencing (GBS) workflow, based on the CanFam 3.1 reference genome.

Targeted GBS methods like AgriSeq provide consistent detection of informative genetic markers, overcoming the limitations of non-targeted approaches such as RADSeq. Using the AgriSeq workflow, hundreds to thousands of markers can be targeted simultaneously with high reproducibility across diverse sample sets. In collaboration with multiple experts and ISAG member laboratories, all markers in the panel have been validated, including 97 SNPs, 6 MNPs, 13 insertions, and 38 deletions. Robustness and field testing confirmed reliable genotyping with canine oral swab DNA samples.

주요 특징

• 154개의 마커로 136개의 유전 질환 및 18개의 형질 분석
• 단순하고 고처리량(High-throughput) 워크플로우
• 친자확인 및 식별 마커와 결합 가능
• 맞춤형 마커 추가로 유연한 패널 구성

>99% 평균 샘플 콜률

AgriSeq GBS 워크플로우를 통해 다양한 개 품종의 구강 면봉 DNA 샘플을 평가한 결과, 대부분의 마커에서 평균 99.5% 샘플 콜률을 달성했습니다. 복제 샘플 간 유전자형 일치율은 99.9% 이상이었으며, 교차 검증 데이터와의 일치율도 99% 이상으로 확인되었습니다.

간단하고 고효율적인 워크플로우

AgriSeq 패널은 최대 768개의 샘플을 하나의 칩에 풀링하여 시퀀싱 비용과 작업량을 크게 절감합니다. 하루에 최대 4개의 384웰 플레이트를 처리할 수 있으며, 3일 이내에 전체 시퀀싱 결과를 얻을 수 있습니다. 수백 개의 샘플을 하나의 시퀀싱 런에서 동시에 분석할 수 있습니다.

맞춤형 패널 구성

AgriSeq 워크플로우는 높은 유연성을 제공하여, 친자확인 및 특정 형질 또는 유전 결함 마커를 결합할 수 있습니다. 번식 프로그램에서 보인 개체 선별이나 형질 분석을 위한 맞춤형 패널 설계가 가능합니다.

The AgriSeq Canine Traits and Disorders Panel, combined with the AgriSeq workflow, provides a streamlined and cost-effective method for canine genotyping of traits and disorders.

NOTE: The CanFam 3.1 reference genome and required analysis files can be obtained by contacting technical support.

사양