Thermo Fisher Scientific MicrobeBridge Software

Applied Biosystems™ MicrobeBridge™ Software

MicrobeBridge™ 소프트웨어는 Applied Biosystems™ Sanger 시퀀서에서 생성된 .ab1 데이터 파일을 CDC의 MicrobeNet™ 데이터베이스와 연결하여 16S rRNA 유전자 서열 분석을 통한 세균 동정을 가능하게 하는 데스크톱 소프트웨어입니다.

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MicrobeNet이란?

MicrobeNet은 CDC에서 구축한 웹 기반 도구로, 16S rRNA 유전자 서열 BLAST 검색을 통해 미생물 병원체를 식별할 수 있습니다. 이 데이터베이스는 세균 및 미생물 종의 유전적·표현형적 특성을 고도로 큐레이션하여 제공합니다.

주요 기능

• Applied Biosystems 시퀀서에서 생성된 .ab1 파일을 가져와 자동 컨티그 조립, 편집, 프라이머 트리밍 및 품질 검사를 수행
• 원클릭으로 MicrobeNet에 연결하여 컨티그 서열을 복사 및 비교
• FASTA 형식으로 컨티그 파일 내보내기 지원
• 읽기 범위 및 품질 상태를 시각적으로 표시하여 데이터 검증 용이
• 컬러 코드 기반 품질 상태 및 썸네일 트레이스 보기 제공

주요 장점

• Sanger 시퀀싱 데이터를 CDC MicrobeNet 참조 데이터베이스와 직접 연결
• 원시 서열 데이터를 자동으로 정리하고 병원체 서열과 매칭
• 수동 데이터 검증 및 BLAST 검색 과정을 간소화

시스템 요구 사항

• 최소 사양: 1.8 GHz 프로세서, 2 GB RAM, 20 GB 이상의 하드 디스크 여유 공간
• 운영 체제: Windows 10 Professional, Windows 7 (32/64-bit SP1)
• 테스트 완료 플랫폼: Windows 10 Professional, Windows 7 SP1

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제품 사양