Thermo Fisher Scientific Sequencing Analysis Software 8, initial license

Thermo Fisher Scientific Sequencing Analysis Software 8 (Initial License)

Applied Biosystems™ Sequencing Analysis Software 8은 DNA 시퀀싱 데이터의 베이스콜, 트리밍, 표시, 편집 및 인쇄를 지원하는 소프트웨어로, Thermo Fisher의 전 라인업인 모세관 DNA 시퀀싱 기기에서 생성된 데이터를 분석하고 품질을 관리할 수 있습니다.

주요 특징

• 데이터 품질 평가: 베이스콜 품질값(QV)을 기반으로 데이터 품질을 정량적으로 평가
• 품질 관리 자동화: 분석 통계가 포함된 리포트를 통해 QC 절차를 가속화
• 자동 트리밍: 저품질 시퀀스 말단을 자동으로 제거하여 데이터 신뢰도 향상

Smart Deep Basecaller (SDB)

Sequencing Analysis Software 8에는 개선된 Smart Deep Basecaller (SDB) 기능(구독 기반)이 포함됩니다. 기존 KB Basecaller 대비 다음과 같은 장점을 제공합니다.

• 5’ 및 3’ 말단에서 더 긴 리드 길이 확보
• 순수 및 혼합 베이스콜 정확도 향상
• 염색체 아티팩트(dye blobs), N-1 peaks, 이동성 변화 등에서의 정확도 개선
• 이형접합 인델 변이(heterozygous indel variants) 분석 정확도 향상
• 수동 검토 시간 단축 및 오탐(false positive) 감소
• 플라스미드 순수 염기 시퀀스의 3’ 말단에서 향상된 시각화 제공

참고: SDB 기능은 SeqStudio Flex, SeqStudio, 3730, 3500 시리즈 기기의 데이터에서 활성화됩니다.
Smart Deep Basecaller는 연간 구독 라이선스가 필요하며, 소프트웨어 구매 시 90일 체험 라이선스가 포함됩니다.
체험 기간 종료 후에는 별도 구독 라이선스를 구매해야 합니다.

• Smart Deep Basecaller 1 Year License ›
• Smart Deep Basecaller 3 Year License ›

SDB 라이선스를 구매하지 않아도 KB Basecaller를 이용하여 소프트웨어를 계속 사용할 수 있습니다.

품질값 기반 시퀀스 검토

사용자는 품질값(QV) 범위를 색상으로 구분하여 저·중·고 품질 염기를 시각적으로 손쉽게 구분할 수 있습니다.
소프트웨어는 저품질 염기를 자동으로 트리밍하고, UI에서 회색으로 표시하여 식별을 용이하게 합니다. 또한, 트리밍되지 않은 영역의 평균 품질값을 기반으로 샘플 점수(Sample Score)를 계산합니다.

데이터 검토 시간 단축

QC 리포트를 통해 각 시료의 리드 길이와 평균 품질값(QV)을 한눈에 확인할 수 있으며, 품질 기준에 따라 데이터를 정렬할 수 있습니다.
각 QC 리포트는 원본 데이터 파일로 하이퍼링크되어 있어 빠른 검토가 가능합니다.

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