Thermo Fisher Scientific Oncomine Lung Cell-Free Total Nucleic Acid Research Assay

Thermo Fisher Scientific Oncomine Lung Cell-Free Total Nucleic Acid Research Assay

제품 개요

Oncomine Lung cfTNA Research Assay는 폐암 유래의 세포유리 DNA 및 RNA(cell-free total nucleic acid; cfTNA)를 검출하기 위한 완전한 연구 솔루션의 일부입니다. 전혈의 혈장 분획으로부터 분리된 cfTNA를 기반으로 라이브러리 제작 및 멀티플렉스 PCR 프라이머 풀을 이용해 증폭 라이브러리를 준비할 수 있습니다.

액체생검의 장점

• 비침습적이며 여러 시점에서 샘플 채취 가능
• 비용 절감 및 신속한 결과 도출
• 종양 이질성 반영에 유리

분석 대상

• Hotspot 유전자 (SNVs 및 short indels): ALK, BRAF, EGFR, ERBB2, KRAS, MAP2K1, MET, NRAS, PIK3CA, ROS1, TP53 (약 168개 핫스팟)
• 유전자 융합: ALK, RET, ROS1
• MET exon 14 skipping
• Copy number gene (CNV): MET

이들 유전자는 비소세포폐암(NSCLC)에서 빈번히 변이되는 것으로 알려져 있습니다.

검출 한계 (LOD) 및 성능

Tag Sequencing 기술을 통해 변이 유형별로 낮은 검출한계를 달성할 수 있습니다.

전체 워크플로우는 MagMAX Cell-Free Total Nucleic Acid Isolation Kit로 cfTNA를 분리한 후, Ion S5 XL 시퀀싱 시스템을 사용하여 약 2일 내에 완료할 수 있습니다.

기술 개요

cfDNA 및 cfRNA는 혈장 내 농도가 매우 낮기 때문에, 본 어세이는 Tag Sequencing 기술을 사용합니다.
이 기술은 유전자 특이적 프라이머에 고유한 분자 태그를 부착하여, 동일한 변이 신호를 가진 그룹만 양성으로 판정하고, 라이브러리 제작 또는 시퀀싱 과정에서 발생한 무작위 오류는 제거합니다.

다른 기술의 1~5% LOD에 비해, 본 어세이는 SNV 기준 0.1%까지 검출 가능하며, 20 ng의 cfDNA 입력량으로 이를 달성할 수 있습니다.

주요 장점

• 짧은 cfDNA에 최적화된 앰플리콘 설계로 높은 캡처 효율
• Tag Sequencing 기술로 위양성 최소화
• 고도로 멀티플렉스된 NGS 설계로 시퀀싱 비용 절감
• 효율적인 2일 워크플로우

분석 소프트웨어

• Torrent Suite Software 5.2 이상: SNV 및 short indel 분석
• Ion Reporter 5.6 이상: SNV, indel, fusion, CNV 분석 (클라우드 또는 서버 기반)

Tag Sequencing 기술의 단순성, 속도, 확장성

• 최소 5 ng의 cfTNA로 타깃 라이브러리 제작 가능
• FFPE 샘플과의 일치성 연구 가능
• 타깃 라이브러리 제작 시간: 약 4시간
• Tag Sequencing Barcode Set 1–24 또는 25–48 (Cat. Nos. A31830, A31847)을 이용해 멀티플렉스 시퀀싱 가능

*민감도 및 특이도는 인공 양성 샘플과 정상 공여자 cfTNA를 이용해 평가되었습니다.

제품 사양

제품 이미지

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